Protein–RNA interactions for Protein: Q96QD8

SLC38A2, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC38A2Q96QD8 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
SLC38A2Q96QD8 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SLC38A2Q96QD8 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SLC38A2Q96QD8 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SLC38A2Q96QD8 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SLC38A2Q96QD8 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SLC38A2Q96QD8 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SLC38A2Q96QD8 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SLC38A2Q96QD8 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SLC38A2Q96QD8 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SLC38A2Q96QD8 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SLC38A2Q96QD8 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SLC38A2Q96QD8 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SLC38A2Q96QD8 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC38A2Q96QD8 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC38A2Q96QD8 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC38A2Q96QD8 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC38A2Q96QD8 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC38A2Q96QD8 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC38A2Q96QD8 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC38A2Q96QD8 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC38A2Q96QD8 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC38A2Q96QD8 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC38A2Q96QD8 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC38A2Q96QD8 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC38A2Q96QD8 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC38A2Q96QD8 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC38A2Q96QD8 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC38A2Q96QD8 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC38A2Q96QD8 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC38A2Q96QD8 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC38A2Q96QD8 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC38A2Q96QD8 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC38A2Q96QD8 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC38A2Q96QD8 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC38A2Q96QD8 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC38A2Q96QD8 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC38A2Q96QD8 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC38A2Q96QD8 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC38A2Q96QD8 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC38A2Q96QD8 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC38A2Q96QD8 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC38A2Q96QD8 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC38A2Q96QD8 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC38A2Q96QD8 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC38A2Q96QD8 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC38A2Q96QD8 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC38A2Q96QD8 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC38A2Q96QD8 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC38A2Q96QD8 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC38A2Q96QD8 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC38A2Q96QD8 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC38A2Q96QD8 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC38A2Q96QD8 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC38A2Q96QD8 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC38A2Q96QD8 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC38A2Q96QD8 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC38A2Q96QD8 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC38A2Q96QD8 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC38A2Q96QD8 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC38A2Q96QD8 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC38A2Q96QD8 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC38A2Q96QD8 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC38A2Q96QD8 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC38A2Q96QD8 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC38A2Q96QD8 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC38A2Q96QD8 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC38A2Q96QD8 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC38A2Q96QD8 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC38A2Q96QD8 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC38A2Q96QD8 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC38A2Q96QD8 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC38A2Q96QD8 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC38A2Q96QD8 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC38A2Q96QD8 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC38A2Q96QD8 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC38A2Q96QD8 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC38A2Q96QD8 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC38A2Q96QD8 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC38A2Q96QD8 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC38A2Q96QD8 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC38A2Q96QD8 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC38A2Q96QD8 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC38A2Q96QD8 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC38A2Q96QD8 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC38A2Q96QD8 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC38A2Q96QD8 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC38A2Q96QD8 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC38A2Q96QD8 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC38A2Q96QD8 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC38A2Q96QD8 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC38A2Q96QD8 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC38A2Q96QD8 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC38A2Q96QD8 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC38A2Q96QD8 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC38A2Q96QD8 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC38A2Q96QD8 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC38A2Q96QD8 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC38A2Q96QD8 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC38A2Q96QD8 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms