Protein–RNA interactions for Protein: Q96PN7

TRERF1, Transcriptional-regulating factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRERF1Q96PN7 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRERF1Q96PN7 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRERF1Q96PN7 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRERF1Q96PN7 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRERF1Q96PN7 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRERF1Q96PN7 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRERF1Q96PN7 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRERF1Q96PN7 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRERF1Q96PN7 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRERF1Q96PN7 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRERF1Q96PN7 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TRERF1Q96PN7 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRERF1Q96PN7 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRERF1Q96PN7 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRERF1Q96PN7 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRERF1Q96PN7 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TRERF1Q96PN7 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TRERF1Q96PN7 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRERF1Q96PN7 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRERF1Q96PN7 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRERF1Q96PN7 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRERF1Q96PN7 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRERF1Q96PN7 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRERF1Q96PN7 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRERF1Q96PN7 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRERF1Q96PN7 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRERF1Q96PN7 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRERF1Q96PN7 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRERF1Q96PN7 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRERF1Q96PN7 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRERF1Q96PN7 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
TRERF1Q96PN7 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRERF1Q96PN7 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRERF1Q96PN7 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
TRERF1Q96PN7 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRERF1Q96PN7 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRERF1Q96PN7 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRERF1Q96PN7 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRERF1Q96PN7 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRERF1Q96PN7 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRERF1Q96PN7 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRERF1Q96PN7 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRERF1Q96PN7 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRERF1Q96PN7 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRERF1Q96PN7 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRERF1Q96PN7 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRERF1Q96PN7 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
TRERF1Q96PN7 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRERF1Q96PN7 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRERF1Q96PN7 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRERF1Q96PN7 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRERF1Q96PN7 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRERF1Q96PN7 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRERF1Q96PN7 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRERF1Q96PN7 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRERF1Q96PN7 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRERF1Q96PN7 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRERF1Q96PN7 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
TRERF1Q96PN7 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRERF1Q96PN7 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRERF1Q96PN7 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
TRERF1Q96PN7 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRERF1Q96PN7 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRERF1Q96PN7 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRERF1Q96PN7 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRERF1Q96PN7 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRERF1Q96PN7 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRERF1Q96PN7 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRERF1Q96PN7 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRERF1Q96PN7 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRERF1Q96PN7 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRERF1Q96PN7 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRERF1Q96PN7 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRERF1Q96PN7 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRERF1Q96PN7 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRERF1Q96PN7 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRERF1Q96PN7 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRERF1Q96PN7 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TRERF1Q96PN7 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRERF1Q96PN7 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRERF1Q96PN7 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRERF1Q96PN7 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRERF1Q96PN7 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRERF1Q96PN7 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRERF1Q96PN7 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRERF1Q96PN7 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRERF1Q96PN7 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRERF1Q96PN7 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRERF1Q96PN7 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRERF1Q96PN7 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRERF1Q96PN7 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRERF1Q96PN7 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRERF1Q96PN7 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRERF1Q96PN7 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TRERF1Q96PN7 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRERF1Q96PN7 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRERF1Q96PN7 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TRERF1Q96PN7 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRERF1Q96PN7 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRERF1Q96PN7 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms