Protein–RNA interactions for Protein: Q96MX0

CMTM3, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM3Q96MX0 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CMTM3Q96MX0 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CMTM3Q96MX0 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CMTM3Q96MX0 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CMTM3Q96MX0 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CMTM3Q96MX0 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CMTM3Q96MX0 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CMTM3Q96MX0 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CMTM3Q96MX0 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CMTM3Q96MX0 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CMTM3Q96MX0 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CMTM3Q96MX0 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CMTM3Q96MX0 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CMTM3Q96MX0 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CMTM3Q96MX0 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CMTM3Q96MX0 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CMTM3Q96MX0 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CMTM3Q96MX0 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CMTM3Q96MX0 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CMTM3Q96MX0 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CMTM3Q96MX0 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CMTM3Q96MX0 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CMTM3Q96MX0 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CMTM3Q96MX0 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CMTM3Q96MX0 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CMTM3Q96MX0 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CMTM3Q96MX0 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CMTM3Q96MX0 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CMTM3Q96MX0 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CMTM3Q96MX0 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CMTM3Q96MX0 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CMTM3Q96MX0 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CMTM3Q96MX0 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CMTM3Q96MX0 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CMTM3Q96MX0 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CMTM3Q96MX0 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CMTM3Q96MX0 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CMTM3Q96MX0 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CMTM3Q96MX0 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CMTM3Q96MX0 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CMTM3Q96MX0 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CMTM3Q96MX0 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CMTM3Q96MX0 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CMTM3Q96MX0 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CMTM3Q96MX0 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CMTM3Q96MX0 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CMTM3Q96MX0 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CMTM3Q96MX0 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CMTM3Q96MX0 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CMTM3Q96MX0 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CMTM3Q96MX0 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CMTM3Q96MX0 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CMTM3Q96MX0 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CMTM3Q96MX0 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CMTM3Q96MX0 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CMTM3Q96MX0 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CMTM3Q96MX0 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CMTM3Q96MX0 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CMTM3Q96MX0 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CMTM3Q96MX0 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CMTM3Q96MX0 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CMTM3Q96MX0 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CMTM3Q96MX0 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CMTM3Q96MX0 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CMTM3Q96MX0 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CMTM3Q96MX0 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CMTM3Q96MX0 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CMTM3Q96MX0 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CMTM3Q96MX0 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CMTM3Q96MX0 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CMTM3Q96MX0 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CMTM3Q96MX0 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CMTM3Q96MX0 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CMTM3Q96MX0 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CMTM3Q96MX0 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CMTM3Q96MX0 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CMTM3Q96MX0 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CMTM3Q96MX0 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CMTM3Q96MX0 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CMTM3Q96MX0 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CMTM3Q96MX0 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CMTM3Q96MX0 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CMTM3Q96MX0 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CMTM3Q96MX0 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CMTM3Q96MX0 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CMTM3Q96MX0 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CMTM3Q96MX0 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CMTM3Q96MX0 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CMTM3Q96MX0 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CMTM3Q96MX0 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CMTM3Q96MX0 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CMTM3Q96MX0 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CMTM3Q96MX0 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CMTM3Q96MX0 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CMTM3Q96MX0 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CMTM3Q96MX0 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CMTM3Q96MX0 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CMTM3Q96MX0 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CMTM3Q96MX0 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CMTM3Q96MX0 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms