Protein–RNA interactions for Protein: Q96MW1

CCDC43, Coiled-coil domain-containing protein 43, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC43Q96MW1 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC43Q96MW1 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC43Q96MW1 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC43Q96MW1 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC43Q96MW1 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC43Q96MW1 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC43Q96MW1 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC43Q96MW1 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC43Q96MW1 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC43Q96MW1 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC43Q96MW1 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC43Q96MW1 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC43Q96MW1 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC43Q96MW1 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC43Q96MW1 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC43Q96MW1 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC43Q96MW1 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC43Q96MW1 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC43Q96MW1 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC43Q96MW1 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC43Q96MW1 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC43Q96MW1 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC43Q96MW1 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC43Q96MW1 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC43Q96MW1 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC43Q96MW1 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC43Q96MW1 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC43Q96MW1 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC43Q96MW1 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC43Q96MW1 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC43Q96MW1 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC43Q96MW1 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC43Q96MW1 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC43Q96MW1 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC43Q96MW1 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC43Q96MW1 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC43Q96MW1 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC43Q96MW1 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC43Q96MW1 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC43Q96MW1 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC43Q96MW1 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC43Q96MW1 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC43Q96MW1 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC43Q96MW1 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC43Q96MW1 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC43Q96MW1 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC43Q96MW1 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC43Q96MW1 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CCDC43Q96MW1 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CCDC43Q96MW1 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
CCDC43Q96MW1 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CCDC43Q96MW1 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC43Q96MW1 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC43Q96MW1 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC43Q96MW1 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC43Q96MW1 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC43Q96MW1 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC43Q96MW1 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC43Q96MW1 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC43Q96MW1 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC43Q96MW1 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC43Q96MW1 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC43Q96MW1 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC43Q96MW1 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC43Q96MW1 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC43Q96MW1 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC43Q96MW1 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC43Q96MW1 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC43Q96MW1 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC43Q96MW1 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC43Q96MW1 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC43Q96MW1 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC43Q96MW1 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC43Q96MW1 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC43Q96MW1 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC43Q96MW1 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC43Q96MW1 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC43Q96MW1 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC43Q96MW1 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC43Q96MW1 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC43Q96MW1 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC43Q96MW1 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC43Q96MW1 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC43Q96MW1 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC43Q96MW1 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC43Q96MW1 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC43Q96MW1 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC43Q96MW1 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC43Q96MW1 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC43Q96MW1 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC43Q96MW1 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC43Q96MW1 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC43Q96MW1 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC43Q96MW1 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC43Q96MW1 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC43Q96MW1 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC43Q96MW1 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC43Q96MW1 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC43Q96MW1 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC43Q96MW1 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms