Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB2

COG3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG3Q96JB2 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
COG3Q96JB2 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
COG3Q96JB2 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
COG3Q96JB2 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
COG3Q96JB2 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
COG3Q96JB2 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
COG3Q96JB2 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
COG3Q96JB2 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
COG3Q96JB2 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
COG3Q96JB2 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
COG3Q96JB2 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
COG3Q96JB2 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
COG3Q96JB2 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
COG3Q96JB2 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
COG3Q96JB2 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
COG3Q96JB2 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
COG3Q96JB2 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
COG3Q96JB2 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
COG3Q96JB2 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
COG3Q96JB2 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
COG3Q96JB2 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
COG3Q96JB2 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
COG3Q96JB2 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
COG3Q96JB2 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
COG3Q96JB2 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
COG3Q96JB2 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
COG3Q96JB2 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
COG3Q96JB2 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
COG3Q96JB2 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
COG3Q96JB2 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
COG3Q96JB2 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
COG3Q96JB2 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
COG3Q96JB2 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
COG3Q96JB2 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
COG3Q96JB2 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
COG3Q96JB2 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
COG3Q96JB2 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
COG3Q96JB2 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
COG3Q96JB2 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
COG3Q96JB2 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
COG3Q96JB2 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
COG3Q96JB2 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
COG3Q96JB2 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
COG3Q96JB2 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
COG3Q96JB2 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
COG3Q96JB2 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
COG3Q96JB2 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
COG3Q96JB2 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
COG3Q96JB2 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
COG3Q96JB2 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
COG3Q96JB2 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
COG3Q96JB2 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
COG3Q96JB2 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC26.2■■□□□ 1.78
COG3Q96JB2 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
COG3Q96JB2 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
COG3Q96JB2 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
COG3Q96JB2 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
COG3Q96JB2 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
COG3Q96JB2 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
COG3Q96JB2 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
COG3Q96JB2 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
COG3Q96JB2 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
COG3Q96JB2 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
COG3Q96JB2 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
COG3Q96JB2 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
COG3Q96JB2 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
COG3Q96JB2 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
COG3Q96JB2 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
COG3Q96JB2 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
COG3Q96JB2 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
COG3Q96JB2 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
COG3Q96JB2 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
COG3Q96JB2 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
COG3Q96JB2 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
COG3Q96JB2 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
COG3Q96JB2 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
COG3Q96JB2 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
COG3Q96JB2 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
COG3Q96JB2 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
COG3Q96JB2 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
COG3Q96JB2 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
COG3Q96JB2 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
COG3Q96JB2 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
COG3Q96JB2 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
COG3Q96JB2 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
COG3Q96JB2 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
COG3Q96JB2 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
COG3Q96JB2 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
COG3Q96JB2 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
COG3Q96JB2 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
COG3Q96JB2 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
COG3Q96JB2 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
COG3Q96JB2 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
COG3Q96JB2 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
COG3Q96JB2 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
COG3Q96JB2 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
COG3Q96JB2 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
COG3Q96JB2 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
COG3Q96JB2 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
COG3Q96JB2 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms