Protein–RNA interactions for Protein: Q96DX7

TRIM44, Tripartite motif-containing protein 44, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM44Q96DX7 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM44Q96DX7 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM44Q96DX7 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM44Q96DX7 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM44Q96DX7 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM44Q96DX7 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM44Q96DX7 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM44Q96DX7 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM44Q96DX7 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM44Q96DX7 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM44Q96DX7 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM44Q96DX7 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM44Q96DX7 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM44Q96DX7 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM44Q96DX7 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM44Q96DX7 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM44Q96DX7 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM44Q96DX7 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM44Q96DX7 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM44Q96DX7 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM44Q96DX7 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM44Q96DX7 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM44Q96DX7 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM44Q96DX7 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TRIM44Q96DX7 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TRIM44Q96DX7 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM44Q96DX7 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM44Q96DX7 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM44Q96DX7 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM44Q96DX7 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM44Q96DX7 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM44Q96DX7 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM44Q96DX7 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM44Q96DX7 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM44Q96DX7 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM44Q96DX7 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM44Q96DX7 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM44Q96DX7 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM44Q96DX7 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM44Q96DX7 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM44Q96DX7 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM44Q96DX7 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM44Q96DX7 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM44Q96DX7 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM44Q96DX7 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM44Q96DX7 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM44Q96DX7 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM44Q96DX7 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM44Q96DX7 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM44Q96DX7 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM44Q96DX7 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM44Q96DX7 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM44Q96DX7 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM44Q96DX7 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM44Q96DX7 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM44Q96DX7 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM44Q96DX7 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM44Q96DX7 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM44Q96DX7 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM44Q96DX7 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM44Q96DX7 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM44Q96DX7 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM44Q96DX7 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM44Q96DX7 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM44Q96DX7 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM44Q96DX7 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM44Q96DX7 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM44Q96DX7 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM44Q96DX7 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM44Q96DX7 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM44Q96DX7 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM44Q96DX7 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM44Q96DX7 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM44Q96DX7 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM44Q96DX7 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM44Q96DX7 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM44Q96DX7 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM44Q96DX7 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM44Q96DX7 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM44Q96DX7 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM44Q96DX7 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM44Q96DX7 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM44Q96DX7 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM44Q96DX7 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM44Q96DX7 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM44Q96DX7 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM44Q96DX7 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM44Q96DX7 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM44Q96DX7 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM44Q96DX7 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM44Q96DX7 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM44Q96DX7 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM44Q96DX7 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM44Q96DX7 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM44Q96DX7 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM44Q96DX7 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM44Q96DX7 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM44Q96DX7 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM44Q96DX7 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM44Q96DX7 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms