Protein–RNA interactions for Protein: Q92837

FRAT1, Proto-oncogene FRAT1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRAT1Q92837 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
FRAT1Q92837 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
FRAT1Q92837 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
FRAT1Q92837 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
FRAT1Q92837 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
FRAT1Q92837 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
FRAT1Q92837 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
FRAT1Q92837 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
FRAT1Q92837 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
FRAT1Q92837 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
FRAT1Q92837 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
FRAT1Q92837 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
FRAT1Q92837 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
FRAT1Q92837 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
FRAT1Q92837 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
FRAT1Q92837 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
FRAT1Q92837 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
FRAT1Q92837 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
FRAT1Q92837 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
FRAT1Q92837 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FRAT1Q92837 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FRAT1Q92837 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FRAT1Q92837 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
FRAT1Q92837 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FRAT1Q92837 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FRAT1Q92837 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
FRAT1Q92837 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
FRAT1Q92837 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
FRAT1Q92837 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FRAT1Q92837 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
FRAT1Q92837 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FRAT1Q92837 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
FRAT1Q92837 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FRAT1Q92837 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
FRAT1Q92837 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FRAT1Q92837 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
FRAT1Q92837 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FRAT1Q92837 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
FRAT1Q92837 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
FRAT1Q92837 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FRAT1Q92837 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FRAT1Q92837 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FRAT1Q92837 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FRAT1Q92837 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
FRAT1Q92837 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FRAT1Q92837 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
FRAT1Q92837 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
FRAT1Q92837 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
FRAT1Q92837 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FRAT1Q92837 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FRAT1Q92837 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
FRAT1Q92837 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
FRAT1Q92837 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FRAT1Q92837 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FRAT1Q92837 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
FRAT1Q92837 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FRAT1Q92837 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
FRAT1Q92837 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FRAT1Q92837 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
FRAT1Q92837 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
FRAT1Q92837 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FRAT1Q92837 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
FRAT1Q92837 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
FRAT1Q92837 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
FRAT1Q92837 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FRAT1Q92837 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
FRAT1Q92837 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
FRAT1Q92837 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
FRAT1Q92837 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
FRAT1Q92837 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
FRAT1Q92837 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
FRAT1Q92837 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
FRAT1Q92837 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
FRAT1Q92837 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
FRAT1Q92837 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
FRAT1Q92837 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
FRAT1Q92837 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
FRAT1Q92837 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
FRAT1Q92837 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
FRAT1Q92837 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
FRAT1Q92837 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
FRAT1Q92837 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
FRAT1Q92837 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
FRAT1Q92837 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
FRAT1Q92837 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
FRAT1Q92837 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
FRAT1Q92837 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
FRAT1Q92837 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
FRAT1Q92837 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
FRAT1Q92837 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
FRAT1Q92837 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
FRAT1Q92837 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
FRAT1Q92837 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
FRAT1Q92837 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
FRAT1Q92837 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
FRAT1Q92837 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
FRAT1Q92837 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
FRAT1Q92837 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
FRAT1Q92837 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FRAT1Q92837 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms