Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXE1

ATRIP, ATR-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRIPQ8WXE1 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATRIPQ8WXE1 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATRIPQ8WXE1 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATRIPQ8WXE1 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATRIPQ8WXE1 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATRIPQ8WXE1 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATRIPQ8WXE1 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ATRIPQ8WXE1 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ATRIPQ8WXE1 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATRIPQ8WXE1 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATRIPQ8WXE1 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATRIPQ8WXE1 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATRIPQ8WXE1 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATRIPQ8WXE1 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ATRIPQ8WXE1 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATRIPQ8WXE1 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATRIPQ8WXE1 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATRIPQ8WXE1 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATRIPQ8WXE1 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATRIPQ8WXE1 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ATRIPQ8WXE1 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ATRIPQ8WXE1 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATRIPQ8WXE1 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATRIPQ8WXE1 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATRIPQ8WXE1 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATRIPQ8WXE1 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATRIPQ8WXE1 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATRIPQ8WXE1 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATRIPQ8WXE1 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATRIPQ8WXE1 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATRIPQ8WXE1 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATRIPQ8WXE1 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATRIPQ8WXE1 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATRIPQ8WXE1 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATRIPQ8WXE1 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATRIPQ8WXE1 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATRIPQ8WXE1 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATRIPQ8WXE1 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATRIPQ8WXE1 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATRIPQ8WXE1 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATRIPQ8WXE1 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATRIPQ8WXE1 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATRIPQ8WXE1 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ATRIPQ8WXE1 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATRIPQ8WXE1 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATRIPQ8WXE1 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATRIPQ8WXE1 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATRIPQ8WXE1 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATRIPQ8WXE1 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATRIPQ8WXE1 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATRIPQ8WXE1 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ATRIPQ8WXE1 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATRIPQ8WXE1 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATRIPQ8WXE1 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATRIPQ8WXE1 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATRIPQ8WXE1 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATRIPQ8WXE1 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATRIPQ8WXE1 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATRIPQ8WXE1 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATRIPQ8WXE1 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATRIPQ8WXE1 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATRIPQ8WXE1 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATRIPQ8WXE1 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATRIPQ8WXE1 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATRIPQ8WXE1 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATRIPQ8WXE1 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATRIPQ8WXE1 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATRIPQ8WXE1 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATRIPQ8WXE1 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATRIPQ8WXE1 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATRIPQ8WXE1 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ATRIPQ8WXE1 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATRIPQ8WXE1 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATRIPQ8WXE1 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATRIPQ8WXE1 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATRIPQ8WXE1 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATRIPQ8WXE1 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATRIPQ8WXE1 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATRIPQ8WXE1 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATRIPQ8WXE1 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATRIPQ8WXE1 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATRIPQ8WXE1 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATRIPQ8WXE1 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATRIPQ8WXE1 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATRIPQ8WXE1 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATRIPQ8WXE1 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATRIPQ8WXE1 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATRIPQ8WXE1 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATRIPQ8WXE1 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATRIPQ8WXE1 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATRIPQ8WXE1 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATRIPQ8WXE1 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
ATRIPQ8WXE1 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
ATRIPQ8WXE1 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATRIPQ8WXE1 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATRIPQ8WXE1 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATRIPQ8WXE1 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATRIPQ8WXE1 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATRIPQ8WXE1 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATRIPQ8WXE1 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms