Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEQ0

SNX29, Sorting nexin-29, humanhuman

Predictions only

Length 813 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX29Q8TEQ0 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNX29Q8TEQ0 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNX29Q8TEQ0 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNX29Q8TEQ0 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNX29Q8TEQ0 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNX29Q8TEQ0 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNX29Q8TEQ0 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNX29Q8TEQ0 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNX29Q8TEQ0 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNX29Q8TEQ0 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNX29Q8TEQ0 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNX29Q8TEQ0 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNX29Q8TEQ0 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNX29Q8TEQ0 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNX29Q8TEQ0 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNX29Q8TEQ0 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SNX29Q8TEQ0 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNX29Q8TEQ0 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SNX29Q8TEQ0 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNX29Q8TEQ0 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNX29Q8TEQ0 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNX29Q8TEQ0 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SNX29Q8TEQ0 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNX29Q8TEQ0 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNX29Q8TEQ0 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNX29Q8TEQ0 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNX29Q8TEQ0 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNX29Q8TEQ0 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNX29Q8TEQ0 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNX29Q8TEQ0 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNX29Q8TEQ0 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNX29Q8TEQ0 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SNX29Q8TEQ0 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SNX29Q8TEQ0 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SNX29Q8TEQ0 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SNX29Q8TEQ0 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SNX29Q8TEQ0 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SNX29Q8TEQ0 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SNX29Q8TEQ0 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SNX29Q8TEQ0 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SNX29Q8TEQ0 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SNX29Q8TEQ0 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SNX29Q8TEQ0 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SNX29Q8TEQ0 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SNX29Q8TEQ0 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SNX29Q8TEQ0 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SNX29Q8TEQ0 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SNX29Q8TEQ0 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SNX29Q8TEQ0 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SNX29Q8TEQ0 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SNX29Q8TEQ0 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SNX29Q8TEQ0 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SNX29Q8TEQ0 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SNX29Q8TEQ0 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SNX29Q8TEQ0 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SNX29Q8TEQ0 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SNX29Q8TEQ0 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SNX29Q8TEQ0 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SNX29Q8TEQ0 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SNX29Q8TEQ0 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SNX29Q8TEQ0 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SNX29Q8TEQ0 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SNX29Q8TEQ0 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SNX29Q8TEQ0 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SNX29Q8TEQ0 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SNX29Q8TEQ0 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SNX29Q8TEQ0 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SNX29Q8TEQ0 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SNX29Q8TEQ0 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SNX29Q8TEQ0 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SNX29Q8TEQ0 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SNX29Q8TEQ0 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SNX29Q8TEQ0 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SNX29Q8TEQ0 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SNX29Q8TEQ0 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SNX29Q8TEQ0 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SNX29Q8TEQ0 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SNX29Q8TEQ0 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SNX29Q8TEQ0 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SNX29Q8TEQ0 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SNX29Q8TEQ0 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SNX29Q8TEQ0 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SNX29Q8TEQ0 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SNX29Q8TEQ0 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SNX29Q8TEQ0 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SNX29Q8TEQ0 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SNX29Q8TEQ0 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SNX29Q8TEQ0 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SNX29Q8TEQ0 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SNX29Q8TEQ0 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SNX29Q8TEQ0 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
SNX29Q8TEQ0 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
SNX29Q8TEQ0 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SNX29Q8TEQ0 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SNX29Q8TEQ0 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SNX29Q8TEQ0 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SNX29Q8TEQ0 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SNX29Q8TEQ0 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SNX29Q8TEQ0 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SNX29Q8TEQ0 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms