Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEP4

C17orf47, Uncharacterized protein C17orf47, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C17orf47Q8NEP4 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C17orf47Q8NEP4 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
C17orf47Q8NEP4 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C17orf47Q8NEP4 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
C17orf47Q8NEP4 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C17orf47Q8NEP4 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
C17orf47Q8NEP4 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C17orf47Q8NEP4 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
C17orf47Q8NEP4 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C17orf47Q8NEP4 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
C17orf47Q8NEP4 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C17orf47Q8NEP4 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C17orf47Q8NEP4 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C17orf47Q8NEP4 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
C17orf47Q8NEP4 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
C17orf47Q8NEP4 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C17orf47Q8NEP4 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C17orf47Q8NEP4 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
C17orf47Q8NEP4 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C17orf47Q8NEP4 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C17orf47Q8NEP4 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C17orf47Q8NEP4 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
C17orf47Q8NEP4 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
C17orf47Q8NEP4 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
C17orf47Q8NEP4 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
C17orf47Q8NEP4 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
C17orf47Q8NEP4 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
C17orf47Q8NEP4 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C17orf47Q8NEP4 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C17orf47Q8NEP4 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C17orf47Q8NEP4 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
C17orf47Q8NEP4 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C17orf47Q8NEP4 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
C17orf47Q8NEP4 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
C17orf47Q8NEP4 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
C17orf47Q8NEP4 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
C17orf47Q8NEP4 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
C17orf47Q8NEP4 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C17orf47Q8NEP4 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
C17orf47Q8NEP4 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C17orf47Q8NEP4 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
C17orf47Q8NEP4 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
C17orf47Q8NEP4 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
C17orf47Q8NEP4 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C17orf47Q8NEP4 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
C17orf47Q8NEP4 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C17orf47Q8NEP4 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C17orf47Q8NEP4 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
C17orf47Q8NEP4 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
C17orf47Q8NEP4 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
C17orf47Q8NEP4 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
C17orf47Q8NEP4 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
C17orf47Q8NEP4 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
C17orf47Q8NEP4 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
C17orf47Q8NEP4 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
C17orf47Q8NEP4 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C17orf47Q8NEP4 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C17orf47Q8NEP4 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C17orf47Q8NEP4 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
C17orf47Q8NEP4 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
C17orf47Q8NEP4 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C17orf47Q8NEP4 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
C17orf47Q8NEP4 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C17orf47Q8NEP4 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C17orf47Q8NEP4 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C17orf47Q8NEP4 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C17orf47Q8NEP4 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C17orf47Q8NEP4 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
C17orf47Q8NEP4 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
C17orf47Q8NEP4 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
C17orf47Q8NEP4 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
C17orf47Q8NEP4 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C17orf47Q8NEP4 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
C17orf47Q8NEP4 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C17orf47Q8NEP4 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C17orf47Q8NEP4 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
C17orf47Q8NEP4 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
C17orf47Q8NEP4 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
C17orf47Q8NEP4 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C17orf47Q8NEP4 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
C17orf47Q8NEP4 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C17orf47Q8NEP4 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
C17orf47Q8NEP4 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
C17orf47Q8NEP4 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
C17orf47Q8NEP4 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
C17orf47Q8NEP4 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
C17orf47Q8NEP4 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
C17orf47Q8NEP4 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C17orf47Q8NEP4 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C17orf47Q8NEP4 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C17orf47Q8NEP4 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C17orf47Q8NEP4 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C17orf47Q8NEP4 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C17orf47Q8NEP4 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C17orf47Q8NEP4 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C17orf47Q8NEP4 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
C17orf47Q8NEP4 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
C17orf47Q8NEP4 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
C17orf47Q8NEP4 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
C17orf47Q8NEP4 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms