Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEB9

PIK3C3, Phosphatidylinositol 3-kinase catalytic subunit type 3, humanhuman

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3C3Q8NEB9 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PIK3C3Q8NEB9 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PIK3C3Q8NEB9 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PIK3C3Q8NEB9 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PIK3C3Q8NEB9 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PIK3C3Q8NEB9 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PIK3C3Q8NEB9 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PIK3C3Q8NEB9 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PIK3C3Q8NEB9 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PIK3C3Q8NEB9 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PIK3C3Q8NEB9 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PIK3C3Q8NEB9 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PIK3C3Q8NEB9 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PIK3C3Q8NEB9 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PIK3C3Q8NEB9 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PIK3C3Q8NEB9 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PIK3C3Q8NEB9 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PIK3C3Q8NEB9 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PIK3C3Q8NEB9 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PIK3C3Q8NEB9 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PIK3C3Q8NEB9 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PIK3C3Q8NEB9 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PIK3C3Q8NEB9 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PIK3C3Q8NEB9 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PIK3C3Q8NEB9 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PIK3C3Q8NEB9 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PIK3C3Q8NEB9 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PIK3C3Q8NEB9 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PIK3C3Q8NEB9 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PIK3C3Q8NEB9 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PIK3C3Q8NEB9 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PIK3C3Q8NEB9 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PIK3C3Q8NEB9 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PIK3C3Q8NEB9 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PIK3C3Q8NEB9 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PIK3C3Q8NEB9 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PIK3C3Q8NEB9 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PIK3C3Q8NEB9 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PIK3C3Q8NEB9 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PIK3C3Q8NEB9 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PIK3C3Q8NEB9 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PIK3C3Q8NEB9 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PIK3C3Q8NEB9 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
PIK3C3Q8NEB9 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
PIK3C3Q8NEB9 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
PIK3C3Q8NEB9 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
PIK3C3Q8NEB9 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
PIK3C3Q8NEB9 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PIK3C3Q8NEB9 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PIK3C3Q8NEB9 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PIK3C3Q8NEB9 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PIK3C3Q8NEB9 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PIK3C3Q8NEB9 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PIK3C3Q8NEB9 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PIK3C3Q8NEB9 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PIK3C3Q8NEB9 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PIK3C3Q8NEB9 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PIK3C3Q8NEB9 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PIK3C3Q8NEB9 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PIK3C3Q8NEB9 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PIK3C3Q8NEB9 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PIK3C3Q8NEB9 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PIK3C3Q8NEB9 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PIK3C3Q8NEB9 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PIK3C3Q8NEB9 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PIK3C3Q8NEB9 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PIK3C3Q8NEB9 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PIK3C3Q8NEB9 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PIK3C3Q8NEB9 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PIK3C3Q8NEB9 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PIK3C3Q8NEB9 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PIK3C3Q8NEB9 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PIK3C3Q8NEB9 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PIK3C3Q8NEB9 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PIK3C3Q8NEB9 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PIK3C3Q8NEB9 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PIK3C3Q8NEB9 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PIK3C3Q8NEB9 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PIK3C3Q8NEB9 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PIK3C3Q8NEB9 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PIK3C3Q8NEB9 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PIK3C3Q8NEB9 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PIK3C3Q8NEB9 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PIK3C3Q8NEB9 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PIK3C3Q8NEB9 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PIK3C3Q8NEB9 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PIK3C3Q8NEB9 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PIK3C3Q8NEB9 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PIK3C3Q8NEB9 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PIK3C3Q8NEB9 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PIK3C3Q8NEB9 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PIK3C3Q8NEB9 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PIK3C3Q8NEB9 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PIK3C3Q8NEB9 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PIK3C3Q8NEB9 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PIK3C3Q8NEB9 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PIK3C3Q8NEB9 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PIK3C3Q8NEB9 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PIK3C3Q8NEB9 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PIK3C3Q8NEB9 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57 ms