Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND23

CARMIL3, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL3Q8ND23 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CARMIL3Q8ND23 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CARMIL3Q8ND23 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CARMIL3Q8ND23 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CARMIL3Q8ND23 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CARMIL3Q8ND23 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CARMIL3Q8ND23 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CARMIL3Q8ND23 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CARMIL3Q8ND23 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CARMIL3Q8ND23 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CARMIL3Q8ND23 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CARMIL3Q8ND23 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CARMIL3Q8ND23 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CARMIL3Q8ND23 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CARMIL3Q8ND23 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CARMIL3Q8ND23 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CARMIL3Q8ND23 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CARMIL3Q8ND23 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CARMIL3Q8ND23 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CARMIL3Q8ND23 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CARMIL3Q8ND23 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CARMIL3Q8ND23 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CARMIL3Q8ND23 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CARMIL3Q8ND23 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CARMIL3Q8ND23 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CARMIL3Q8ND23 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CARMIL3Q8ND23 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CARMIL3Q8ND23 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CARMIL3Q8ND23 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CARMIL3Q8ND23 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CARMIL3Q8ND23 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CARMIL3Q8ND23 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CARMIL3Q8ND23 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CARMIL3Q8ND23 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CARMIL3Q8ND23 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CARMIL3Q8ND23 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CARMIL3Q8ND23 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CARMIL3Q8ND23 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CARMIL3Q8ND23 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CARMIL3Q8ND23 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CARMIL3Q8ND23 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CARMIL3Q8ND23 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CARMIL3Q8ND23 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CARMIL3Q8ND23 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CARMIL3Q8ND23 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CARMIL3Q8ND23 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CARMIL3Q8ND23 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CARMIL3Q8ND23 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CARMIL3Q8ND23 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CARMIL3Q8ND23 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CARMIL3Q8ND23 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CARMIL3Q8ND23 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CARMIL3Q8ND23 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CARMIL3Q8ND23 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CARMIL3Q8ND23 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CARMIL3Q8ND23 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CARMIL3Q8ND23 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CARMIL3Q8ND23 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CARMIL3Q8ND23 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CARMIL3Q8ND23 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CARMIL3Q8ND23 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CARMIL3Q8ND23 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CARMIL3Q8ND23 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CARMIL3Q8ND23 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CARMIL3Q8ND23 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CARMIL3Q8ND23 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CARMIL3Q8ND23 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CARMIL3Q8ND23 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CARMIL3Q8ND23 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CARMIL3Q8ND23 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CARMIL3Q8ND23 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CARMIL3Q8ND23 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CARMIL3Q8ND23 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CARMIL3Q8ND23 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CARMIL3Q8ND23 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CARMIL3Q8ND23 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CARMIL3Q8ND23 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CARMIL3Q8ND23 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CARMIL3Q8ND23 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CARMIL3Q8ND23 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CARMIL3Q8ND23 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CARMIL3Q8ND23 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CARMIL3Q8ND23 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CARMIL3Q8ND23 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CARMIL3Q8ND23 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CARMIL3Q8ND23 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CARMIL3Q8ND23 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CARMIL3Q8ND23 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CARMIL3Q8ND23 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CARMIL3Q8ND23 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CARMIL3Q8ND23 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CARMIL3Q8ND23 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CARMIL3Q8ND23 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CARMIL3Q8ND23 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CARMIL3Q8ND23 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CARMIL3Q8ND23 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CARMIL3Q8ND23 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CARMIL3Q8ND23 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CARMIL3Q8ND23 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CARMIL3Q8ND23 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms