Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBT2

SPC24, Kinetochore protein Spc24, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPC24Q8NBT2 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SPC24Q8NBT2 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SPC24Q8NBT2 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SPC24Q8NBT2 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SPC24Q8NBT2 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SPC24Q8NBT2 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SPC24Q8NBT2 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SPC24Q8NBT2 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SPC24Q8NBT2 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SPC24Q8NBT2 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SPC24Q8NBT2 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SPC24Q8NBT2 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SPC24Q8NBT2 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SPC24Q8NBT2 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SPC24Q8NBT2 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SPC24Q8NBT2 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SPC24Q8NBT2 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SPC24Q8NBT2 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SPC24Q8NBT2 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SPC24Q8NBT2 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SPC24Q8NBT2 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SPC24Q8NBT2 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SPC24Q8NBT2 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SPC24Q8NBT2 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SPC24Q8NBT2 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SPC24Q8NBT2 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SPC24Q8NBT2 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SPC24Q8NBT2 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SPC24Q8NBT2 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SPC24Q8NBT2 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SPC24Q8NBT2 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SPC24Q8NBT2 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SPC24Q8NBT2 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SPC24Q8NBT2 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SPC24Q8NBT2 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SPC24Q8NBT2 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SPC24Q8NBT2 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SPC24Q8NBT2 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SPC24Q8NBT2 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SPC24Q8NBT2 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SPC24Q8NBT2 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SPC24Q8NBT2 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SPC24Q8NBT2 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SPC24Q8NBT2 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SPC24Q8NBT2 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SPC24Q8NBT2 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SPC24Q8NBT2 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SPC24Q8NBT2 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SPC24Q8NBT2 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SPC24Q8NBT2 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SPC24Q8NBT2 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SPC24Q8NBT2 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SPC24Q8NBT2 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SPC24Q8NBT2 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SPC24Q8NBT2 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SPC24Q8NBT2 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SPC24Q8NBT2 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SPC24Q8NBT2 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SPC24Q8NBT2 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SPC24Q8NBT2 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SPC24Q8NBT2 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SPC24Q8NBT2 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SPC24Q8NBT2 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SPC24Q8NBT2 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SPC24Q8NBT2 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SPC24Q8NBT2 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SPC24Q8NBT2 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SPC24Q8NBT2 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SPC24Q8NBT2 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SPC24Q8NBT2 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SPC24Q8NBT2 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SPC24Q8NBT2 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SPC24Q8NBT2 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SPC24Q8NBT2 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SPC24Q8NBT2 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SPC24Q8NBT2 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SPC24Q8NBT2 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SPC24Q8NBT2 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SPC24Q8NBT2 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SPC24Q8NBT2 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SPC24Q8NBT2 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SPC24Q8NBT2 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SPC24Q8NBT2 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SPC24Q8NBT2 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SPC24Q8NBT2 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SPC24Q8NBT2 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SPC24Q8NBT2 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SPC24Q8NBT2 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SPC24Q8NBT2 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SPC24Q8NBT2 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SPC24Q8NBT2 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SPC24Q8NBT2 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SPC24Q8NBT2 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SPC24Q8NBT2 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SPC24Q8NBT2 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SPC24Q8NBT2 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SPC24Q8NBT2 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SPC24Q8NBT2 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SPC24Q8NBT2 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SPC24Q8NBT2 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms