Protein–RNA interactions for Protein: Q7L099

RUFY3, Protein RUFY3, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY3Q7L099 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RUFY3Q7L099 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RUFY3Q7L099 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RUFY3Q7L099 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
RUFY3Q7L099 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RUFY3Q7L099 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RUFY3Q7L099 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RUFY3Q7L099 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RUFY3Q7L099 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RUFY3Q7L099 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RUFY3Q7L099 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RUFY3Q7L099 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RUFY3Q7L099 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RUFY3Q7L099 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RUFY3Q7L099 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
RUFY3Q7L099 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RUFY3Q7L099 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
RUFY3Q7L099 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RUFY3Q7L099 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RUFY3Q7L099 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RUFY3Q7L099 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RUFY3Q7L099 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RUFY3Q7L099 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RUFY3Q7L099 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RUFY3Q7L099 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RUFY3Q7L099 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RUFY3Q7L099 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RUFY3Q7L099 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RUFY3Q7L099 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RUFY3Q7L099 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RUFY3Q7L099 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RUFY3Q7L099 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RUFY3Q7L099 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RUFY3Q7L099 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RUFY3Q7L099 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RUFY3Q7L099 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RUFY3Q7L099 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RUFY3Q7L099 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RUFY3Q7L099 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RUFY3Q7L099 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RUFY3Q7L099 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RUFY3Q7L099 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RUFY3Q7L099 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RUFY3Q7L099 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RUFY3Q7L099 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RUFY3Q7L099 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RUFY3Q7L099 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RUFY3Q7L099 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RUFY3Q7L099 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RUFY3Q7L099 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RUFY3Q7L099 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RUFY3Q7L099 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RUFY3Q7L099 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RUFY3Q7L099 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RUFY3Q7L099 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RUFY3Q7L099 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RUFY3Q7L099 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RUFY3Q7L099 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RUFY3Q7L099 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RUFY3Q7L099 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RUFY3Q7L099 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RUFY3Q7L099 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RUFY3Q7L099 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RUFY3Q7L099 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RUFY3Q7L099 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
RUFY3Q7L099 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RUFY3Q7L099 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RUFY3Q7L099 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RUFY3Q7L099 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
RUFY3Q7L099 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RUFY3Q7L099 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
RUFY3Q7L099 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RUFY3Q7L099 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RUFY3Q7L099 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RUFY3Q7L099 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
RUFY3Q7L099 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RUFY3Q7L099 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
RUFY3Q7L099 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RUFY3Q7L099 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RUFY3Q7L099 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RUFY3Q7L099 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RUFY3Q7L099 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
RUFY3Q7L099 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RUFY3Q7L099 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RUFY3Q7L099 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RUFY3Q7L099 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RUFY3Q7L099 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
RUFY3Q7L099 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
RUFY3Q7L099 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
RUFY3Q7L099 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RUFY3Q7L099 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
RUFY3Q7L099 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RUFY3Q7L099 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
RUFY3Q7L099 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RUFY3Q7L099 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC23■■□□□ 1.27
RUFY3Q7L099 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RUFY3Q7L099 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RUFY3Q7L099 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RUFY3Q7L099 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RUFY3Q7L099 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms