Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSB3

LINC00299, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00299, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00299Q6ZSB3 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LINC00299Q6ZSB3 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LINC00299Q6ZSB3 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
LINC00299Q6ZSB3 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LINC00299Q6ZSB3 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LINC00299Q6ZSB3 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LINC00299Q6ZSB3 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LINC00299Q6ZSB3 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LINC00299Q6ZSB3 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LINC00299Q6ZSB3 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LINC00299Q6ZSB3 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LINC00299Q6ZSB3 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
LINC00299Q6ZSB3 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LINC00299Q6ZSB3 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LINC00299Q6ZSB3 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LINC00299Q6ZSB3 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LINC00299Q6ZSB3 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
LINC00299Q6ZSB3 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
LINC00299Q6ZSB3 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
LINC00299Q6ZSB3 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
LINC00299Q6ZSB3 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.33
LINC00299Q6ZSB3 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LINC00299Q6ZSB3 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LINC00299Q6ZSB3 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
LINC00299Q6ZSB3 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LINC00299Q6ZSB3 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LINC00299Q6ZSB3 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LINC00299Q6ZSB3 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LINC00299Q6ZSB3 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LINC00299Q6ZSB3 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LINC00299Q6ZSB3 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LINC00299Q6ZSB3 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LINC00299Q6ZSB3 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LINC00299Q6ZSB3 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LINC00299Q6ZSB3 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LINC00299Q6ZSB3 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
LINC00299Q6ZSB3 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LINC00299Q6ZSB3 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LINC00299Q6ZSB3 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LINC00299Q6ZSB3 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LINC00299Q6ZSB3 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LINC00299Q6ZSB3 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LINC00299Q6ZSB3 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LINC00299Q6ZSB3 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LINC00299Q6ZSB3 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LINC00299Q6ZSB3 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LINC00299Q6ZSB3 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LINC00299Q6ZSB3 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LINC00299Q6ZSB3 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LINC00299Q6ZSB3 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
LINC00299Q6ZSB3 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LINC00299Q6ZSB3 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LINC00299Q6ZSB3 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LINC00299Q6ZSB3 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LINC00299Q6ZSB3 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LINC00299Q6ZSB3 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LINC00299Q6ZSB3 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LINC00299Q6ZSB3 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LINC00299Q6ZSB3 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LINC00299Q6ZSB3 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LINC00299Q6ZSB3 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LINC00299Q6ZSB3 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LINC00299Q6ZSB3 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LINC00299Q6ZSB3 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LINC00299Q6ZSB3 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LINC00299Q6ZSB3 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LINC00299Q6ZSB3 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LINC00299Q6ZSB3 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LINC00299Q6ZSB3 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LINC00299Q6ZSB3 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LINC00299Q6ZSB3 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LINC00299Q6ZSB3 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LINC00299Q6ZSB3 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LINC00299Q6ZSB3 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LINC00299Q6ZSB3 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LINC00299Q6ZSB3 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LINC00299Q6ZSB3 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LINC00299Q6ZSB3 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LINC00299Q6ZSB3 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LINC00299Q6ZSB3 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LINC00299Q6ZSB3 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LINC00299Q6ZSB3 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LINC00299Q6ZSB3 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LINC00299Q6ZSB3 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LINC00299Q6ZSB3 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
LINC00299Q6ZSB3 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LINC00299Q6ZSB3 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LINC00299Q6ZSB3 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LINC00299Q6ZSB3 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LINC00299Q6ZSB3 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LINC00299Q6ZSB3 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LINC00299Q6ZSB3 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LINC00299Q6ZSB3 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LINC00299Q6ZSB3 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
LINC00299Q6ZSB3 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
LINC00299Q6ZSB3 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LINC00299Q6ZSB3 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LINC00299Q6ZSB3 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LINC00299Q6ZSB3 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LINC00299Q6ZSB3 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms