Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMY3

SPOCD1, SPOC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCD1Q6ZMY3 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SPOCD1Q6ZMY3 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SPOCD1Q6ZMY3 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SPOCD1Q6ZMY3 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SPOCD1Q6ZMY3 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SPOCD1Q6ZMY3 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SPOCD1Q6ZMY3 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SPOCD1Q6ZMY3 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SPOCD1Q6ZMY3 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SPOCD1Q6ZMY3 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SPOCD1Q6ZMY3 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SPOCD1Q6ZMY3 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SPOCD1Q6ZMY3 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SPOCD1Q6ZMY3 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SPOCD1Q6ZMY3 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SPOCD1Q6ZMY3 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SPOCD1Q6ZMY3 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SPOCD1Q6ZMY3 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SPOCD1Q6ZMY3 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SPOCD1Q6ZMY3 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SPOCD1Q6ZMY3 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SPOCD1Q6ZMY3 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SPOCD1Q6ZMY3 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SPOCD1Q6ZMY3 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SPOCD1Q6ZMY3 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SPOCD1Q6ZMY3 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SPOCD1Q6ZMY3 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SPOCD1Q6ZMY3 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SPOCD1Q6ZMY3 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SPOCD1Q6ZMY3 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SPOCD1Q6ZMY3 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SPOCD1Q6ZMY3 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SPOCD1Q6ZMY3 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SPOCD1Q6ZMY3 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SPOCD1Q6ZMY3 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SPOCD1Q6ZMY3 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SPOCD1Q6ZMY3 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SPOCD1Q6ZMY3 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SPOCD1Q6ZMY3 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SPOCD1Q6ZMY3 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SPOCD1Q6ZMY3 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SPOCD1Q6ZMY3 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SPOCD1Q6ZMY3 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SPOCD1Q6ZMY3 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SPOCD1Q6ZMY3 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SPOCD1Q6ZMY3 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SPOCD1Q6ZMY3 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SPOCD1Q6ZMY3 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SPOCD1Q6ZMY3 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SPOCD1Q6ZMY3 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SPOCD1Q6ZMY3 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SPOCD1Q6ZMY3 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SPOCD1Q6ZMY3 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SPOCD1Q6ZMY3 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SPOCD1Q6ZMY3 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SPOCD1Q6ZMY3 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SPOCD1Q6ZMY3 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SPOCD1Q6ZMY3 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SPOCD1Q6ZMY3 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SPOCD1Q6ZMY3 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SPOCD1Q6ZMY3 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SPOCD1Q6ZMY3 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SPOCD1Q6ZMY3 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SPOCD1Q6ZMY3 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SPOCD1Q6ZMY3 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SPOCD1Q6ZMY3 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SPOCD1Q6ZMY3 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SPOCD1Q6ZMY3 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SPOCD1Q6ZMY3 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SPOCD1Q6ZMY3 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SPOCD1Q6ZMY3 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SPOCD1Q6ZMY3 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SPOCD1Q6ZMY3 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SPOCD1Q6ZMY3 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SPOCD1Q6ZMY3 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SPOCD1Q6ZMY3 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SPOCD1Q6ZMY3 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SPOCD1Q6ZMY3 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SPOCD1Q6ZMY3 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SPOCD1Q6ZMY3 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SPOCD1Q6ZMY3 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SPOCD1Q6ZMY3 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SPOCD1Q6ZMY3 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SPOCD1Q6ZMY3 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SPOCD1Q6ZMY3 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SPOCD1Q6ZMY3 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SPOCD1Q6ZMY3 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SPOCD1Q6ZMY3 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SPOCD1Q6ZMY3 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SPOCD1Q6ZMY3 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SPOCD1Q6ZMY3 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SPOCD1Q6ZMY3 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SPOCD1Q6ZMY3 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SPOCD1Q6ZMY3 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SPOCD1Q6ZMY3 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SPOCD1Q6ZMY3 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SPOCD1Q6ZMY3 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SPOCD1Q6ZMY3 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SPOCD1Q6ZMY3 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SPOCD1Q6ZMY3 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms