Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZI2

CAVIN1, Caveolae-associated protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN1Q6NZI2 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CAVIN1Q6NZI2 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CAVIN1Q6NZI2 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CAVIN1Q6NZI2 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CAVIN1Q6NZI2 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CAVIN1Q6NZI2 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CAVIN1Q6NZI2 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CAVIN1Q6NZI2 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CAVIN1Q6NZI2 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CAVIN1Q6NZI2 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CAVIN1Q6NZI2 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CAVIN1Q6NZI2 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CAVIN1Q6NZI2 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CAVIN1Q6NZI2 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CAVIN1Q6NZI2 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CAVIN1Q6NZI2 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CAVIN1Q6NZI2 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CAVIN1Q6NZI2 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CAVIN1Q6NZI2 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CAVIN1Q6NZI2 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CAVIN1Q6NZI2 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CAVIN1Q6NZI2 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CAVIN1Q6NZI2 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAVIN1Q6NZI2 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAVIN1Q6NZI2 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAVIN1Q6NZI2 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAVIN1Q6NZI2 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAVIN1Q6NZI2 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CAVIN1Q6NZI2 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAVIN1Q6NZI2 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAVIN1Q6NZI2 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAVIN1Q6NZI2 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAVIN1Q6NZI2 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAVIN1Q6NZI2 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAVIN1Q6NZI2 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAVIN1Q6NZI2 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAVIN1Q6NZI2 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAVIN1Q6NZI2 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAVIN1Q6NZI2 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAVIN1Q6NZI2 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAVIN1Q6NZI2 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAVIN1Q6NZI2 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAVIN1Q6NZI2 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAVIN1Q6NZI2 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAVIN1Q6NZI2 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CAVIN1Q6NZI2 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CAVIN1Q6NZI2 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CAVIN1Q6NZI2 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CAVIN1Q6NZI2 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CAVIN1Q6NZI2 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CAVIN1Q6NZI2 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CAVIN1Q6NZI2 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CAVIN1Q6NZI2 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CAVIN1Q6NZI2 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CAVIN1Q6NZI2 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CAVIN1Q6NZI2 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CAVIN1Q6NZI2 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CAVIN1Q6NZI2 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CAVIN1Q6NZI2 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CAVIN1Q6NZI2 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CAVIN1Q6NZI2 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CAVIN1Q6NZI2 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CAVIN1Q6NZI2 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CAVIN1Q6NZI2 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CAVIN1Q6NZI2 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CAVIN1Q6NZI2 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CAVIN1Q6NZI2 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CAVIN1Q6NZI2 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CAVIN1Q6NZI2 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CAVIN1Q6NZI2 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CAVIN1Q6NZI2 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CAVIN1Q6NZI2 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CAVIN1Q6NZI2 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CAVIN1Q6NZI2 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CAVIN1Q6NZI2 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CAVIN1Q6NZI2 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CAVIN1Q6NZI2 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CAVIN1Q6NZI2 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CAVIN1Q6NZI2 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CAVIN1Q6NZI2 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CAVIN1Q6NZI2 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CAVIN1Q6NZI2 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CAVIN1Q6NZI2 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CAVIN1Q6NZI2 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CAVIN1Q6NZI2 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CAVIN1Q6NZI2 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CAVIN1Q6NZI2 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CAVIN1Q6NZI2 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CAVIN1Q6NZI2 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CAVIN1Q6NZI2 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CAVIN1Q6NZI2 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CAVIN1Q6NZI2 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CAVIN1Q6NZI2 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CAVIN1Q6NZI2 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CAVIN1Q6NZI2 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CAVIN1Q6NZI2 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CAVIN1Q6NZI2 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CAVIN1Q6NZI2 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CAVIN1Q6NZI2 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CAVIN1Q6NZI2 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms