Protein–RNA interactions for Protein: Q6IBW4

NCAPH2, Condensin-2 complex subunit H2, humanhuman

Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPH2Q6IBW4 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NCAPH2Q6IBW4 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NCAPH2Q6IBW4 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NCAPH2Q6IBW4 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NCAPH2Q6IBW4 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NCAPH2Q6IBW4 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NCAPH2Q6IBW4 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NCAPH2Q6IBW4 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NCAPH2Q6IBW4 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NCAPH2Q6IBW4 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NCAPH2Q6IBW4 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NCAPH2Q6IBW4 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NCAPH2Q6IBW4 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NCAPH2Q6IBW4 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
NCAPH2Q6IBW4 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NCAPH2Q6IBW4 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
NCAPH2Q6IBW4 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NCAPH2Q6IBW4 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NCAPH2Q6IBW4 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NCAPH2Q6IBW4 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NCAPH2Q6IBW4 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NCAPH2Q6IBW4 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NCAPH2Q6IBW4 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NCAPH2Q6IBW4 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NCAPH2Q6IBW4 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NCAPH2Q6IBW4 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NCAPH2Q6IBW4 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NCAPH2Q6IBW4 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
NCAPH2Q6IBW4 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NCAPH2Q6IBW4 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NCAPH2Q6IBW4 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NCAPH2Q6IBW4 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NCAPH2Q6IBW4 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NCAPH2Q6IBW4 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NCAPH2Q6IBW4 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NCAPH2Q6IBW4 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NCAPH2Q6IBW4 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NCAPH2Q6IBW4 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NCAPH2Q6IBW4 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NCAPH2Q6IBW4 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NCAPH2Q6IBW4 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NCAPH2Q6IBW4 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NCAPH2Q6IBW4 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NCAPH2Q6IBW4 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NCAPH2Q6IBW4 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NCAPH2Q6IBW4 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NCAPH2Q6IBW4 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NCAPH2Q6IBW4 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NCAPH2Q6IBW4 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
NCAPH2Q6IBW4 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NCAPH2Q6IBW4 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NCAPH2Q6IBW4 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NCAPH2Q6IBW4 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NCAPH2Q6IBW4 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NCAPH2Q6IBW4 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NCAPH2Q6IBW4 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NCAPH2Q6IBW4 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NCAPH2Q6IBW4 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NCAPH2Q6IBW4 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NCAPH2Q6IBW4 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NCAPH2Q6IBW4 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NCAPH2Q6IBW4 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NCAPH2Q6IBW4 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NCAPH2Q6IBW4 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NCAPH2Q6IBW4 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NCAPH2Q6IBW4 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NCAPH2Q6IBW4 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NCAPH2Q6IBW4 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NCAPH2Q6IBW4 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NCAPH2Q6IBW4 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NCAPH2Q6IBW4 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NCAPH2Q6IBW4 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NCAPH2Q6IBW4 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NCAPH2Q6IBW4 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NCAPH2Q6IBW4 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NCAPH2Q6IBW4 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NCAPH2Q6IBW4 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NCAPH2Q6IBW4 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NCAPH2Q6IBW4 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NCAPH2Q6IBW4 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NCAPH2Q6IBW4 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NCAPH2Q6IBW4 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NCAPH2Q6IBW4 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NCAPH2Q6IBW4 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NCAPH2Q6IBW4 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NCAPH2Q6IBW4 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NCAPH2Q6IBW4 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NCAPH2Q6IBW4 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NCAPH2Q6IBW4 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NCAPH2Q6IBW4 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NCAPH2Q6IBW4 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NCAPH2Q6IBW4 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NCAPH2Q6IBW4 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NCAPH2Q6IBW4 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NCAPH2Q6IBW4 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NCAPH2Q6IBW4 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NCAPH2Q6IBW4 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NCAPH2Q6IBW4 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NCAPH2Q6IBW4 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NCAPH2Q6IBW4 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms