Protein–RNA interactions for Protein: Q60I27

ALS2CL, ALS2 C-terminal-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2CLQ60I27 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ALS2CLQ60I27 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ALS2CLQ60I27 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ALS2CLQ60I27 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
ALS2CLQ60I27 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ALS2CLQ60I27 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ALS2CLQ60I27 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ALS2CLQ60I27 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ALS2CLQ60I27 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
ALS2CLQ60I27 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
ALS2CLQ60I27 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ALS2CLQ60I27 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ALS2CLQ60I27 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ALS2CLQ60I27 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
ALS2CLQ60I27 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ALS2CLQ60I27 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ALS2CLQ60I27 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ALS2CLQ60I27 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ALS2CLQ60I27 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ALS2CLQ60I27 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ALS2CLQ60I27 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ALS2CLQ60I27 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ALS2CLQ60I27 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ALS2CLQ60I27 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ALS2CLQ60I27 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
ALS2CLQ60I27 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
ALS2CLQ60I27 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
ALS2CLQ60I27 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ALS2CLQ60I27 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ALS2CLQ60I27 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
ALS2CLQ60I27 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ALS2CLQ60I27 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ALS2CLQ60I27 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ALS2CLQ60I27 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ALS2CLQ60I27 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ALS2CLQ60I27 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ALS2CLQ60I27 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ALS2CLQ60I27 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ALS2CLQ60I27 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ALS2CLQ60I27 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ALS2CLQ60I27 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ALS2CLQ60I27 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ALS2CLQ60I27 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ALS2CLQ60I27 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ALS2CLQ60I27 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ALS2CLQ60I27 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ALS2CLQ60I27 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ALS2CLQ60I27 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ALS2CLQ60I27 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ALS2CLQ60I27 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ALS2CLQ60I27 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ALS2CLQ60I27 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
ALS2CLQ60I27 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ALS2CLQ60I27 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ALS2CLQ60I27 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ALS2CLQ60I27 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ALS2CLQ60I27 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
ALS2CLQ60I27 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ALS2CLQ60I27 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ALS2CLQ60I27 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ALS2CLQ60I27 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ALS2CLQ60I27 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ALS2CLQ60I27 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ALS2CLQ60I27 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ALS2CLQ60I27 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ALS2CLQ60I27 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ALS2CLQ60I27 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ALS2CLQ60I27 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ALS2CLQ60I27 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ALS2CLQ60I27 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ALS2CLQ60I27 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ALS2CLQ60I27 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ALS2CLQ60I27 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ALS2CLQ60I27 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ALS2CLQ60I27 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ALS2CLQ60I27 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
ALS2CLQ60I27 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ALS2CLQ60I27 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ALS2CLQ60I27 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ALS2CLQ60I27 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ALS2CLQ60I27 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ALS2CLQ60I27 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ALS2CLQ60I27 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ALS2CLQ60I27 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ALS2CLQ60I27 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
ALS2CLQ60I27 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ALS2CLQ60I27 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ALS2CLQ60I27 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ALS2CLQ60I27 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ALS2CLQ60I27 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ALS2CLQ60I27 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ALS2CLQ60I27 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ALS2CLQ60I27 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ALS2CLQ60I27 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ALS2CLQ60I27 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ALS2CLQ60I27 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ALS2CLQ60I27 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ALS2CLQ60I27 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ALS2CLQ60I27 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ALS2CLQ60I27 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms