Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXU3

CHIC1, Cysteine-rich hydrophobic domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHIC1Q5VXU3 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
CHIC1Q5VXU3 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
CHIC1Q5VXU3 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
CHIC1Q5VXU3 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
CHIC1Q5VXU3 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
CHIC1Q5VXU3 AL445228.1-201ENST00000449525 333 ntTSL 3 BASIC33.42■■■□□ 2.94
CHIC1Q5VXU3 AL022319.1-201ENST00000458183 1167 ntBASIC33.42■■■□□ 2.94
CHIC1Q5VXU3 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
CHIC1Q5VXU3 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC33.42■■■□□ 2.94
CHIC1Q5VXU3 AP001981.1-201ENST00000531132 738 ntBASIC33.42■■■□□ 2.94
CHIC1Q5VXU3 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
CHIC1Q5VXU3 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
CHIC1Q5VXU3 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
CHIC1Q5VXU3 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
CHIC1Q5VXU3 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
CHIC1Q5VXU3 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
CHIC1Q5VXU3 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
CHIC1Q5VXU3 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
CHIC1Q5VXU3 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
CHIC1Q5VXU3 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
CHIC1Q5VXU3 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
CHIC1Q5VXU3 AC007161.1-201ENST00000418534 1061 ntTSL 3 BASIC33.41■■■□□ 2.94
CHIC1Q5VXU3 AC024597.1-201ENST00000442753 706 ntTSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
CHIC1Q5VXU3 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
CHIC1Q5VXU3 SMIM8-207ENST00000608525 735 ntTSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
CHIC1Q5VXU3 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
CHIC1Q5VXU3 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC33.41■■■□□ 2.94
CHIC1Q5VXU3 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
CHIC1Q5VXU3 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
CHIC1Q5VXU3 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
CHIC1Q5VXU3 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
CHIC1Q5VXU3 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
CHIC1Q5VXU3 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
CHIC1Q5VXU3 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
CHIC1Q5VXU3 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
CHIC1Q5VXU3 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.4■■■□□ 2.94
CHIC1Q5VXU3 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
CHIC1Q5VXU3 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
CHIC1Q5VXU3 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
CHIC1Q5VXU3 BTG3P1-201ENST00000435859 716 ntBASIC33.4■■■□□ 2.94
CHIC1Q5VXU3 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC33.4■■■□□ 2.94
CHIC1Q5VXU3 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
CHIC1Q5VXU3 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
CHIC1Q5VXU3 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC33.4■■■□□ 2.94
CHIC1Q5VXU3 AC138907.10-201ENST00000623708 983 ntBASIC33.4■■■□□ 2.94
CHIC1Q5VXU3 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
CHIC1Q5VXU3 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
CHIC1Q5VXU3 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
CHIC1Q5VXU3 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
CHIC1Q5VXU3 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
CHIC1Q5VXU3 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
CHIC1Q5VXU3 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
CHIC1Q5VXU3 OR5B12-201ENST00000302572 1054 ntAPPRIS P1 BASIC33.39■■■□□ 2.94
CHIC1Q5VXU3 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
CHIC1Q5VXU3 AL121949.1-201ENST00000402043 968 ntBASIC33.39■■■□□ 2.94
CHIC1Q5VXU3 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC33.39■■■□□ 2.94
CHIC1Q5VXU3 AP001020.1-201ENST00000579595 464 ntTSL 3 BASIC33.39■■■□□ 2.94
CHIC1Q5VXU3 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
CHIC1Q5VXU3 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
CHIC1Q5VXU3 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.93
CHIC1Q5VXU3 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
CHIC1Q5VXU3 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
CHIC1Q5VXU3 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
CHIC1Q5VXU3 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
CHIC1Q5VXU3 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC33.38■■■□□ 2.93
CHIC1Q5VXU3 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
CHIC1Q5VXU3 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC33.38■■■□□ 2.93
CHIC1Q5VXU3 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC33.38■■■□□ 2.93
CHIC1Q5VXU3 AL031430.1-201ENST00000642067 1039 ntBASIC33.38■■■□□ 2.93
CHIC1Q5VXU3 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
CHIC1Q5VXU3 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
CHIC1Q5VXU3 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
CHIC1Q5VXU3 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
CHIC1Q5VXU3 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
CHIC1Q5VXU3 AC104457.2-201ENST00000446055 467 ntTSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
CHIC1Q5VXU3 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
CHIC1Q5VXU3 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.37■■■□□ 2.93
CHIC1Q5VXU3 AC012181.2-201ENST00000570210 699 ntBASIC33.37■■■□□ 2.93
CHIC1Q5VXU3 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
CHIC1Q5VXU3 UBE2NL-201ENST00000618570 1185 ntAPPRIS P1 BASIC33.37■■■□□ 2.93
CHIC1Q5VXU3 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC33.37■■■□□ 2.93
CHIC1Q5VXU3 AL109924.4-201ENST00000623089 670 ntBASIC33.37■■■□□ 2.93
CHIC1Q5VXU3 AC009039.2-201ENST00000624524 529 ntBASIC33.37■■■□□ 2.93
CHIC1Q5VXU3 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
CHIC1Q5VXU3 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
CHIC1Q5VXU3 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
CHIC1Q5VXU3 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
CHIC1Q5VXU3 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
CHIC1Q5VXU3 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
CHIC1Q5VXU3 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
CHIC1Q5VXU3 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
CHIC1Q5VXU3 CT45A11P-201ENST00000448043 1134 ntBASIC33.36■■■□□ 2.93
CHIC1Q5VXU3 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
CHIC1Q5VXU3 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
CHIC1Q5VXU3 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
CHIC1Q5VXU3 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
CHIC1Q5VXU3 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
CHIC1Q5VXU3 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
CHIC1Q5VXU3 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
CHIC1Q5VXU3 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms