Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWQ0

RSBN1, Round spermatid basic protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 802 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSBN1Q5VWQ0 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RSBN1Q5VWQ0 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RSBN1Q5VWQ0 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RSBN1Q5VWQ0 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RSBN1Q5VWQ0 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RSBN1Q5VWQ0 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RSBN1Q5VWQ0 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RSBN1Q5VWQ0 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RSBN1Q5VWQ0 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RSBN1Q5VWQ0 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RSBN1Q5VWQ0 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RSBN1Q5VWQ0 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RSBN1Q5VWQ0 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RSBN1Q5VWQ0 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RSBN1Q5VWQ0 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RSBN1Q5VWQ0 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RSBN1Q5VWQ0 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RSBN1Q5VWQ0 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RSBN1Q5VWQ0 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RSBN1Q5VWQ0 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
RSBN1Q5VWQ0 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RSBN1Q5VWQ0 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RSBN1Q5VWQ0 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RSBN1Q5VWQ0 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RSBN1Q5VWQ0 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RSBN1Q5VWQ0 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
RSBN1Q5VWQ0 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RSBN1Q5VWQ0 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RSBN1Q5VWQ0 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RSBN1Q5VWQ0 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RSBN1Q5VWQ0 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RSBN1Q5VWQ0 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RSBN1Q5VWQ0 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RSBN1Q5VWQ0 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RSBN1Q5VWQ0 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RSBN1Q5VWQ0 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RSBN1Q5VWQ0 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RSBN1Q5VWQ0 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RSBN1Q5VWQ0 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RSBN1Q5VWQ0 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RSBN1Q5VWQ0 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RSBN1Q5VWQ0 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RSBN1Q5VWQ0 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RSBN1Q5VWQ0 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RSBN1Q5VWQ0 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RSBN1Q5VWQ0 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RSBN1Q5VWQ0 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RSBN1Q5VWQ0 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
RSBN1Q5VWQ0 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RSBN1Q5VWQ0 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RSBN1Q5VWQ0 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
RSBN1Q5VWQ0 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RSBN1Q5VWQ0 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RSBN1Q5VWQ0 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RSBN1Q5VWQ0 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
RSBN1Q5VWQ0 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RSBN1Q5VWQ0 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
RSBN1Q5VWQ0 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RSBN1Q5VWQ0 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
RSBN1Q5VWQ0 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RSBN1Q5VWQ0 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RSBN1Q5VWQ0 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RSBN1Q5VWQ0 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RSBN1Q5VWQ0 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RSBN1Q5VWQ0 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RSBN1Q5VWQ0 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RSBN1Q5VWQ0 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RSBN1Q5VWQ0 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RSBN1Q5VWQ0 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RSBN1Q5VWQ0 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RSBN1Q5VWQ0 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RSBN1Q5VWQ0 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RSBN1Q5VWQ0 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RSBN1Q5VWQ0 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RSBN1Q5VWQ0 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RSBN1Q5VWQ0 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RSBN1Q5VWQ0 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RSBN1Q5VWQ0 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RSBN1Q5VWQ0 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RSBN1Q5VWQ0 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RSBN1Q5VWQ0 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RSBN1Q5VWQ0 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RSBN1Q5VWQ0 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RSBN1Q5VWQ0 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RSBN1Q5VWQ0 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RSBN1Q5VWQ0 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RSBN1Q5VWQ0 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RSBN1Q5VWQ0 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RSBN1Q5VWQ0 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RSBN1Q5VWQ0 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RSBN1Q5VWQ0 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RSBN1Q5VWQ0 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RSBN1Q5VWQ0 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RSBN1Q5VWQ0 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RSBN1Q5VWQ0 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
RSBN1Q5VWQ0 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RSBN1Q5VWQ0 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RSBN1Q5VWQ0 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RSBN1Q5VWQ0 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RSBN1Q5VWQ0 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms