Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUJ6

LRCH2, Leucine-rich repeat and calponin homology domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRCH2Q5VUJ6 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRCH2Q5VUJ6 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRCH2Q5VUJ6 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRCH2Q5VUJ6 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRCH2Q5VUJ6 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRCH2Q5VUJ6 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRCH2Q5VUJ6 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRCH2Q5VUJ6 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
LRCH2Q5VUJ6 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRCH2Q5VUJ6 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRCH2Q5VUJ6 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRCH2Q5VUJ6 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRCH2Q5VUJ6 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRCH2Q5VUJ6 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRCH2Q5VUJ6 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRCH2Q5VUJ6 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRCH2Q5VUJ6 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRCH2Q5VUJ6 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRCH2Q5VUJ6 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRCH2Q5VUJ6 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRCH2Q5VUJ6 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRCH2Q5VUJ6 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRCH2Q5VUJ6 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRCH2Q5VUJ6 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRCH2Q5VUJ6 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRCH2Q5VUJ6 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRCH2Q5VUJ6 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRCH2Q5VUJ6 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRCH2Q5VUJ6 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRCH2Q5VUJ6 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRCH2Q5VUJ6 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRCH2Q5VUJ6 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRCH2Q5VUJ6 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
LRCH2Q5VUJ6 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRCH2Q5VUJ6 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRCH2Q5VUJ6 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
LRCH2Q5VUJ6 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
LRCH2Q5VUJ6 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
LRCH2Q5VUJ6 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LRCH2Q5VUJ6 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LRCH2Q5VUJ6 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LRCH2Q5VUJ6 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LRCH2Q5VUJ6 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LRCH2Q5VUJ6 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LRCH2Q5VUJ6 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LRCH2Q5VUJ6 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LRCH2Q5VUJ6 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LRCH2Q5VUJ6 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LRCH2Q5VUJ6 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LRCH2Q5VUJ6 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LRCH2Q5VUJ6 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
LRCH2Q5VUJ6 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
LRCH2Q5VUJ6 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LRCH2Q5VUJ6 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LRCH2Q5VUJ6 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LRCH2Q5VUJ6 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LRCH2Q5VUJ6 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LRCH2Q5VUJ6 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LRCH2Q5VUJ6 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LRCH2Q5VUJ6 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LRCH2Q5VUJ6 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LRCH2Q5VUJ6 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LRCH2Q5VUJ6 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LRCH2Q5VUJ6 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LRCH2Q5VUJ6 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LRCH2Q5VUJ6 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LRCH2Q5VUJ6 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LRCH2Q5VUJ6 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
LRCH2Q5VUJ6 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LRCH2Q5VUJ6 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LRCH2Q5VUJ6 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LRCH2Q5VUJ6 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LRCH2Q5VUJ6 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LRCH2Q5VUJ6 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LRCH2Q5VUJ6 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LRCH2Q5VUJ6 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LRCH2Q5VUJ6 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LRCH2Q5VUJ6 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LRCH2Q5VUJ6 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LRCH2Q5VUJ6 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LRCH2Q5VUJ6 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LRCH2Q5VUJ6 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LRCH2Q5VUJ6 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LRCH2Q5VUJ6 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LRCH2Q5VUJ6 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LRCH2Q5VUJ6 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LRCH2Q5VUJ6 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LRCH2Q5VUJ6 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LRCH2Q5VUJ6 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LRCH2Q5VUJ6 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LRCH2Q5VUJ6 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LRCH2Q5VUJ6 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LRCH2Q5VUJ6 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
LRCH2Q5VUJ6 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LRCH2Q5VUJ6 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LRCH2Q5VUJ6 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LRCH2Q5VUJ6 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LRCH2Q5VUJ6 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LRCH2Q5VUJ6 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LRCH2Q5VUJ6 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms