Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSL9

STRIP1, Striatin-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRIP1Q5VSL9 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
STRIP1Q5VSL9 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
STRIP1Q5VSL9 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
STRIP1Q5VSL9 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
STRIP1Q5VSL9 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
STRIP1Q5VSL9 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
STRIP1Q5VSL9 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
STRIP1Q5VSL9 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
STRIP1Q5VSL9 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
STRIP1Q5VSL9 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
STRIP1Q5VSL9 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
STRIP1Q5VSL9 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
STRIP1Q5VSL9 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
STRIP1Q5VSL9 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
STRIP1Q5VSL9 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
STRIP1Q5VSL9 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
STRIP1Q5VSL9 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
STRIP1Q5VSL9 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
STRIP1Q5VSL9 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
STRIP1Q5VSL9 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
STRIP1Q5VSL9 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
STRIP1Q5VSL9 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
STRIP1Q5VSL9 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
STRIP1Q5VSL9 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
STRIP1Q5VSL9 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
STRIP1Q5VSL9 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
STRIP1Q5VSL9 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
STRIP1Q5VSL9 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
STRIP1Q5VSL9 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
STRIP1Q5VSL9 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
STRIP1Q5VSL9 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
STRIP1Q5VSL9 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
STRIP1Q5VSL9 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
STRIP1Q5VSL9 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
STRIP1Q5VSL9 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
STRIP1Q5VSL9 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
STRIP1Q5VSL9 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
STRIP1Q5VSL9 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
STRIP1Q5VSL9 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
STRIP1Q5VSL9 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
STRIP1Q5VSL9 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
STRIP1Q5VSL9 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
STRIP1Q5VSL9 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
STRIP1Q5VSL9 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
STRIP1Q5VSL9 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
STRIP1Q5VSL9 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
STRIP1Q5VSL9 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
STRIP1Q5VSL9 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
STRIP1Q5VSL9 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
STRIP1Q5VSL9 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
STRIP1Q5VSL9 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
STRIP1Q5VSL9 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
STRIP1Q5VSL9 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
STRIP1Q5VSL9 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
STRIP1Q5VSL9 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
STRIP1Q5VSL9 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
STRIP1Q5VSL9 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
STRIP1Q5VSL9 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
STRIP1Q5VSL9 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
STRIP1Q5VSL9 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
STRIP1Q5VSL9 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
STRIP1Q5VSL9 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
STRIP1Q5VSL9 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
STRIP1Q5VSL9 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
STRIP1Q5VSL9 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
STRIP1Q5VSL9 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
STRIP1Q5VSL9 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
STRIP1Q5VSL9 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
STRIP1Q5VSL9 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
STRIP1Q5VSL9 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
STRIP1Q5VSL9 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
STRIP1Q5VSL9 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
STRIP1Q5VSL9 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
STRIP1Q5VSL9 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
STRIP1Q5VSL9 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
STRIP1Q5VSL9 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
STRIP1Q5VSL9 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
STRIP1Q5VSL9 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
STRIP1Q5VSL9 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
STRIP1Q5VSL9 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
STRIP1Q5VSL9 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
STRIP1Q5VSL9 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
STRIP1Q5VSL9 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
STRIP1Q5VSL9 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
STRIP1Q5VSL9 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
STRIP1Q5VSL9 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
STRIP1Q5VSL9 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
STRIP1Q5VSL9 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
STRIP1Q5VSL9 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
STRIP1Q5VSL9 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
STRIP1Q5VSL9 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
STRIP1Q5VSL9 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
STRIP1Q5VSL9 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
STRIP1Q5VSL9 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
STRIP1Q5VSL9 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
STRIP1Q5VSL9 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
STRIP1Q5VSL9 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
STRIP1Q5VSL9 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
STRIP1Q5VSL9 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
STRIP1Q5VSL9 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms