Protein–RNA interactions for Protein: Q5T0F9

CC2D1B, Coiled-coil and C2 domain-containing protein 1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CC2D1BQ5T0F9 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CC2D1BQ5T0F9 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CC2D1BQ5T0F9 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CC2D1BQ5T0F9 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CC2D1BQ5T0F9 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CC2D1BQ5T0F9 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CC2D1BQ5T0F9 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CC2D1BQ5T0F9 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CC2D1BQ5T0F9 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CC2D1BQ5T0F9 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CC2D1BQ5T0F9 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CC2D1BQ5T0F9 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CC2D1BQ5T0F9 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CC2D1BQ5T0F9 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CC2D1BQ5T0F9 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
CC2D1BQ5T0F9 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CC2D1BQ5T0F9 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CC2D1BQ5T0F9 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CC2D1BQ5T0F9 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
CC2D1BQ5T0F9 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CC2D1BQ5T0F9 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CC2D1BQ5T0F9 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CC2D1BQ5T0F9 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CC2D1BQ5T0F9 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CC2D1BQ5T0F9 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CC2D1BQ5T0F9 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CC2D1BQ5T0F9 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CC2D1BQ5T0F9 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CC2D1BQ5T0F9 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
CC2D1BQ5T0F9 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
CC2D1BQ5T0F9 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
CC2D1BQ5T0F9 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CC2D1BQ5T0F9 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CC2D1BQ5T0F9 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CC2D1BQ5T0F9 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CC2D1BQ5T0F9 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CC2D1BQ5T0F9 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CC2D1BQ5T0F9 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CC2D1BQ5T0F9 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CC2D1BQ5T0F9 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CC2D1BQ5T0F9 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CC2D1BQ5T0F9 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CC2D1BQ5T0F9 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CC2D1BQ5T0F9 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CC2D1BQ5T0F9 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CC2D1BQ5T0F9 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
CC2D1BQ5T0F9 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
CC2D1BQ5T0F9 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CC2D1BQ5T0F9 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CC2D1BQ5T0F9 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CC2D1BQ5T0F9 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CC2D1BQ5T0F9 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CC2D1BQ5T0F9 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CC2D1BQ5T0F9 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CC2D1BQ5T0F9 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CC2D1BQ5T0F9 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CC2D1BQ5T0F9 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CC2D1BQ5T0F9 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CC2D1BQ5T0F9 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CC2D1BQ5T0F9 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CC2D1BQ5T0F9 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CC2D1BQ5T0F9 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CC2D1BQ5T0F9 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CC2D1BQ5T0F9 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CC2D1BQ5T0F9 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CC2D1BQ5T0F9 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CC2D1BQ5T0F9 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CC2D1BQ5T0F9 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CC2D1BQ5T0F9 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CC2D1BQ5T0F9 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CC2D1BQ5T0F9 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CC2D1BQ5T0F9 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CC2D1BQ5T0F9 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CC2D1BQ5T0F9 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CC2D1BQ5T0F9 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CC2D1BQ5T0F9 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CC2D1BQ5T0F9 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CC2D1BQ5T0F9 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CC2D1BQ5T0F9 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CC2D1BQ5T0F9 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CC2D1BQ5T0F9 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CC2D1BQ5T0F9 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CC2D1BQ5T0F9 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CC2D1BQ5T0F9 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
CC2D1BQ5T0F9 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CC2D1BQ5T0F9 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
CC2D1BQ5T0F9 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CC2D1BQ5T0F9 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CC2D1BQ5T0F9 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CC2D1BQ5T0F9 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CC2D1BQ5T0F9 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CC2D1BQ5T0F9 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
CC2D1BQ5T0F9 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CC2D1BQ5T0F9 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CC2D1BQ5T0F9 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CC2D1BQ5T0F9 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CC2D1BQ5T0F9 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CC2D1BQ5T0F9 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CC2D1BQ5T0F9 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
CC2D1BQ5T0F9 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms