Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJE1

CCDC178, Coiled-coil domain-containing protein 178, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC178Q5BJE1 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC178Q5BJE1 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC178Q5BJE1 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC178Q5BJE1 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC178Q5BJE1 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC178Q5BJE1 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC178Q5BJE1 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC178Q5BJE1 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC178Q5BJE1 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC178Q5BJE1 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC178Q5BJE1 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC178Q5BJE1 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC178Q5BJE1 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC178Q5BJE1 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC178Q5BJE1 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC178Q5BJE1 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC178Q5BJE1 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC178Q5BJE1 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC178Q5BJE1 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC178Q5BJE1 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC178Q5BJE1 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC178Q5BJE1 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC178Q5BJE1 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC178Q5BJE1 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC178Q5BJE1 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC178Q5BJE1 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC178Q5BJE1 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC178Q5BJE1 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC178Q5BJE1 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC178Q5BJE1 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC178Q5BJE1 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC178Q5BJE1 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC178Q5BJE1 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC178Q5BJE1 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC178Q5BJE1 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC178Q5BJE1 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC178Q5BJE1 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC178Q5BJE1 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC178Q5BJE1 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC178Q5BJE1 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC178Q5BJE1 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC178Q5BJE1 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC178Q5BJE1 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC178Q5BJE1 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC178Q5BJE1 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC178Q5BJE1 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC178Q5BJE1 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC178Q5BJE1 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC178Q5BJE1 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC178Q5BJE1 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC178Q5BJE1 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC178Q5BJE1 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC178Q5BJE1 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC178Q5BJE1 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC178Q5BJE1 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC178Q5BJE1 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC178Q5BJE1 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC178Q5BJE1 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC178Q5BJE1 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC178Q5BJE1 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC178Q5BJE1 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC178Q5BJE1 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC178Q5BJE1 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC178Q5BJE1 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC178Q5BJE1 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC178Q5BJE1 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC178Q5BJE1 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC178Q5BJE1 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC178Q5BJE1 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC178Q5BJE1 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC178Q5BJE1 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC178Q5BJE1 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC178Q5BJE1 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC178Q5BJE1 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC178Q5BJE1 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC178Q5BJE1 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.23
CCDC178Q5BJE1 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC178Q5BJE1 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC178Q5BJE1 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC178Q5BJE1 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC178Q5BJE1 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC178Q5BJE1 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC178Q5BJE1 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC178Q5BJE1 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC178Q5BJE1 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC178Q5BJE1 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC178Q5BJE1 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC178Q5BJE1 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC178Q5BJE1 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC178Q5BJE1 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC178Q5BJE1 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC178Q5BJE1 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC178Q5BJE1 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC178Q5BJE1 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC178Q5BJE1 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC178Q5BJE1 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC178Q5BJE1 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC178Q5BJE1 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC178Q5BJE1 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC178Q5BJE1 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms