Protein–RNA interactions for Protein: Q52WX2

SBK1, Serine/threonine-protein kinase SBK1, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SBK1Q52WX2 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SBK1Q52WX2 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SBK1Q52WX2 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SBK1Q52WX2 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SBK1Q52WX2 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SBK1Q52WX2 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SBK1Q52WX2 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SBK1Q52WX2 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SBK1Q52WX2 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SBK1Q52WX2 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SBK1Q52WX2 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
SBK1Q52WX2 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SBK1Q52WX2 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SBK1Q52WX2 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SBK1Q52WX2 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SBK1Q52WX2 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SBK1Q52WX2 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SBK1Q52WX2 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SBK1Q52WX2 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SBK1Q52WX2 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SBK1Q52WX2 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SBK1Q52WX2 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SBK1Q52WX2 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SBK1Q52WX2 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SBK1Q52WX2 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SBK1Q52WX2 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SBK1Q52WX2 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SBK1Q52WX2 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SBK1Q52WX2 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SBK1Q52WX2 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SBK1Q52WX2 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SBK1Q52WX2 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SBK1Q52WX2 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SBK1Q52WX2 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SBK1Q52WX2 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SBK1Q52WX2 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SBK1Q52WX2 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SBK1Q52WX2 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SBK1Q52WX2 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SBK1Q52WX2 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SBK1Q52WX2 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SBK1Q52WX2 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SBK1Q52WX2 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SBK1Q52WX2 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SBK1Q52WX2 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SBK1Q52WX2 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SBK1Q52WX2 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SBK1Q52WX2 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SBK1Q52WX2 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SBK1Q52WX2 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SBK1Q52WX2 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SBK1Q52WX2 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SBK1Q52WX2 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SBK1Q52WX2 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SBK1Q52WX2 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SBK1Q52WX2 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SBK1Q52WX2 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SBK1Q52WX2 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SBK1Q52WX2 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SBK1Q52WX2 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SBK1Q52WX2 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SBK1Q52WX2 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SBK1Q52WX2 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SBK1Q52WX2 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SBK1Q52WX2 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SBK1Q52WX2 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SBK1Q52WX2 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SBK1Q52WX2 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SBK1Q52WX2 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SBK1Q52WX2 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SBK1Q52WX2 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SBK1Q52WX2 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SBK1Q52WX2 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SBK1Q52WX2 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SBK1Q52WX2 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SBK1Q52WX2 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SBK1Q52WX2 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SBK1Q52WX2 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SBK1Q52WX2 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SBK1Q52WX2 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SBK1Q52WX2 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SBK1Q52WX2 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SBK1Q52WX2 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SBK1Q52WX2 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SBK1Q52WX2 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SBK1Q52WX2 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SBK1Q52WX2 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SBK1Q52WX2 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SBK1Q52WX2 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SBK1Q52WX2 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SBK1Q52WX2 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SBK1Q52WX2 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SBK1Q52WX2 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SBK1Q52WX2 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SBK1Q52WX2 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SBK1Q52WX2 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SBK1Q52WX2 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SBK1Q52WX2 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SBK1Q52WX2 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SBK1Q52WX2 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms