Protein–RNA interactions for Protein: Q3KNV8

PCGF3, Polycomb group RING finger protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF3Q3KNV8 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PCGF3Q3KNV8 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PCGF3Q3KNV8 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
PCGF3Q3KNV8 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PCGF3Q3KNV8 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PCGF3Q3KNV8 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PCGF3Q3KNV8 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
PCGF3Q3KNV8 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
PCGF3Q3KNV8 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
PCGF3Q3KNV8 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PCGF3Q3KNV8 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PCGF3Q3KNV8 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PCGF3Q3KNV8 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PCGF3Q3KNV8 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PCGF3Q3KNV8 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PCGF3Q3KNV8 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PCGF3Q3KNV8 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PCGF3Q3KNV8 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PCGF3Q3KNV8 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PCGF3Q3KNV8 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
PCGF3Q3KNV8 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
PCGF3Q3KNV8 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
PCGF3Q3KNV8 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
PCGF3Q3KNV8 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
PCGF3Q3KNV8 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
PCGF3Q3KNV8 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PCGF3Q3KNV8 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PCGF3Q3KNV8 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PCGF3Q3KNV8 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PCGF3Q3KNV8 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PCGF3Q3KNV8 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PCGF3Q3KNV8 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PCGF3Q3KNV8 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PCGF3Q3KNV8 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PCGF3Q3KNV8 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PCGF3Q3KNV8 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PCGF3Q3KNV8 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PCGF3Q3KNV8 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PCGF3Q3KNV8 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PCGF3Q3KNV8 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PCGF3Q3KNV8 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PCGF3Q3KNV8 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PCGF3Q3KNV8 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PCGF3Q3KNV8 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PCGF3Q3KNV8 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PCGF3Q3KNV8 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PCGF3Q3KNV8 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PCGF3Q3KNV8 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PCGF3Q3KNV8 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PCGF3Q3KNV8 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PCGF3Q3KNV8 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PCGF3Q3KNV8 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PCGF3Q3KNV8 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PCGF3Q3KNV8 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PCGF3Q3KNV8 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PCGF3Q3KNV8 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PCGF3Q3KNV8 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PCGF3Q3KNV8 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PCGF3Q3KNV8 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PCGF3Q3KNV8 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PCGF3Q3KNV8 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PCGF3Q3KNV8 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PCGF3Q3KNV8 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PCGF3Q3KNV8 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PCGF3Q3KNV8 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PCGF3Q3KNV8 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PCGF3Q3KNV8 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PCGF3Q3KNV8 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PCGF3Q3KNV8 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PCGF3Q3KNV8 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PCGF3Q3KNV8 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PCGF3Q3KNV8 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PCGF3Q3KNV8 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PCGF3Q3KNV8 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PCGF3Q3KNV8 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PCGF3Q3KNV8 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PCGF3Q3KNV8 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PCGF3Q3KNV8 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PCGF3Q3KNV8 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PCGF3Q3KNV8 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PCGF3Q3KNV8 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PCGF3Q3KNV8 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PCGF3Q3KNV8 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PCGF3Q3KNV8 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PCGF3Q3KNV8 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PCGF3Q3KNV8 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PCGF3Q3KNV8 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PCGF3Q3KNV8 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PCGF3Q3KNV8 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PCGF3Q3KNV8 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PCGF3Q3KNV8 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PCGF3Q3KNV8 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PCGF3Q3KNV8 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PCGF3Q3KNV8 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PCGF3Q3KNV8 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PCGF3Q3KNV8 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PCGF3Q3KNV8 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PCGF3Q3KNV8 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PCGF3Q3KNV8 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PCGF3Q3KNV8 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms