Protein–RNA interactions for Protein: Q2TAL6

VWC2, Brorin, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWC2Q2TAL6 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VWC2Q2TAL6 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VWC2Q2TAL6 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VWC2Q2TAL6 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VWC2Q2TAL6 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VWC2Q2TAL6 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VWC2Q2TAL6 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VWC2Q2TAL6 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VWC2Q2TAL6 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VWC2Q2TAL6 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VWC2Q2TAL6 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VWC2Q2TAL6 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VWC2Q2TAL6 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VWC2Q2TAL6 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VWC2Q2TAL6 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VWC2Q2TAL6 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VWC2Q2TAL6 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VWC2Q2TAL6 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
VWC2Q2TAL6 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
VWC2Q2TAL6 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
VWC2Q2TAL6 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
VWC2Q2TAL6 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.05
VWC2Q2TAL6 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
VWC2Q2TAL6 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
VWC2Q2TAL6 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
VWC2Q2TAL6 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
VWC2Q2TAL6 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
VWC2Q2TAL6 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
VWC2Q2TAL6 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
VWC2Q2TAL6 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VWC2Q2TAL6 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
VWC2Q2TAL6 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
VWC2Q2TAL6 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
VWC2Q2TAL6 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
VWC2Q2TAL6 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VWC2Q2TAL6 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
VWC2Q2TAL6 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
VWC2Q2TAL6 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
VWC2Q2TAL6 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
VWC2Q2TAL6 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
VWC2Q2TAL6 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
VWC2Q2TAL6 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VWC2Q2TAL6 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VWC2Q2TAL6 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VWC2Q2TAL6 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
VWC2Q2TAL6 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VWC2Q2TAL6 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VWC2Q2TAL6 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
VWC2Q2TAL6 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VWC2Q2TAL6 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VWC2Q2TAL6 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
VWC2Q2TAL6 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
VWC2Q2TAL6 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VWC2Q2TAL6 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VWC2Q2TAL6 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VWC2Q2TAL6 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VWC2Q2TAL6 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VWC2Q2TAL6 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VWC2Q2TAL6 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VWC2Q2TAL6 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
VWC2Q2TAL6 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VWC2Q2TAL6 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VWC2Q2TAL6 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VWC2Q2TAL6 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VWC2Q2TAL6 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VWC2Q2TAL6 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VWC2Q2TAL6 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VWC2Q2TAL6 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VWC2Q2TAL6 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VWC2Q2TAL6 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VWC2Q2TAL6 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VWC2Q2TAL6 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VWC2Q2TAL6 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VWC2Q2TAL6 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VWC2Q2TAL6 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VWC2Q2TAL6 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VWC2Q2TAL6 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VWC2Q2TAL6 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VWC2Q2TAL6 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VWC2Q2TAL6 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VWC2Q2TAL6 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VWC2Q2TAL6 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VWC2Q2TAL6 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VWC2Q2TAL6 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VWC2Q2TAL6 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VWC2Q2TAL6 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VWC2Q2TAL6 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VWC2Q2TAL6 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VWC2Q2TAL6 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VWC2Q2TAL6 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VWC2Q2TAL6 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VWC2Q2TAL6 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VWC2Q2TAL6 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VWC2Q2TAL6 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VWC2Q2TAL6 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VWC2Q2TAL6 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VWC2Q2TAL6 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VWC2Q2TAL6 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VWC2Q2TAL6 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VWC2Q2TAL6 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms