Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CDO1Q16878 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CDO1Q16878 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CDO1Q16878 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CDO1Q16878 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CDO1Q16878 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CDO1Q16878 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CDO1Q16878 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CDO1Q16878 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CDO1Q16878 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CDO1Q16878 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CDO1Q16878 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CDO1Q16878 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CDO1Q16878 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CDO1Q16878 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CDO1Q16878 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CDO1Q16878 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CDO1Q16878 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CDO1Q16878 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CDO1Q16878 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CDO1Q16878 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CDO1Q16878 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CDO1Q16878 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CDO1Q16878 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CDO1Q16878 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CDO1Q16878 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CDO1Q16878 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CDO1Q16878 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CDO1Q16878 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CDO1Q16878 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CDO1Q16878 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
CDO1Q16878 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
CDO1Q16878 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
CDO1Q16878 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CDO1Q16878 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CDO1Q16878 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CDO1Q16878 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CDO1Q16878 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CDO1Q16878 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CDO1Q16878 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CDO1Q16878 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CDO1Q16878 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CDO1Q16878 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CDO1Q16878 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CDO1Q16878 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CDO1Q16878 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CDO1Q16878 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CDO1Q16878 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CDO1Q16878 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CDO1Q16878 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CDO1Q16878 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CDO1Q16878 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CDO1Q16878 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CDO1Q16878 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CDO1Q16878 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CDO1Q16878 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CDO1Q16878 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CDO1Q16878 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CDO1Q16878 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CDO1Q16878 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CDO1Q16878 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CDO1Q16878 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CDO1Q16878 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CDO1Q16878 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CDO1Q16878 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CDO1Q16878 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CDO1Q16878 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CDO1Q16878 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CDO1Q16878 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CDO1Q16878 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CDO1Q16878 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CDO1Q16878 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CDO1Q16878 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CDO1Q16878 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CDO1Q16878 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CDO1Q16878 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CDO1Q16878 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CDO1Q16878 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDO1Q16878 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDO1Q16878 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDO1Q16878 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDO1Q16878 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDO1Q16878 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDO1Q16878 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDO1Q16878 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDO1Q16878 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDO1Q16878 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDO1Q16878 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDO1Q16878 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDO1Q16878 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDO1Q16878 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDO1Q16878 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDO1Q16878 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDO1Q16878 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDO1Q16878 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDO1Q16878 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDO1Q16878 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDO1Q16878 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDO1Q16878 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDO1Q16878 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.8 ms