Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRNQ16849 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTPRNQ16849 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTPRNQ16849 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPRNQ16849 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPRNQ16849 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPRNQ16849 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPRNQ16849 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPRNQ16849 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPRNQ16849 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPRNQ16849 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPRNQ16849 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPRNQ16849 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPRNQ16849 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPRNQ16849 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPRNQ16849 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPRNQ16849 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPRNQ16849 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPRNQ16849 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
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PTPRNQ16849 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPRNQ16849 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPRNQ16849 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPRNQ16849 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
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PTPRNQ16849 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTPRNQ16849 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTPRNQ16849 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
PTPRNQ16849 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTPRNQ16849 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
PTPRNQ16849 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTPRNQ16849 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTPRNQ16849 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTPRNQ16849 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTPRNQ16849 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTPRNQ16849 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTPRNQ16849 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTPRNQ16849 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTPRNQ16849 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTPRNQ16849 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTPRNQ16849 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTPRNQ16849 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTPRNQ16849 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTPRNQ16849 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTPRNQ16849 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
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PTPRNQ16849 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTPRNQ16849 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTPRNQ16849 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
PTPRNQ16849 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTPRNQ16849 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTPRNQ16849 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTPRNQ16849 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTPRNQ16849 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTPRNQ16849 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTPRNQ16849 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTPRNQ16849 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTPRNQ16849 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTPRNQ16849 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTPRNQ16849 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTPRNQ16849 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTPRNQ16849 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTPRNQ16849 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTPRNQ16849 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTPRNQ16849 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
PTPRNQ16849 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
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PTPRNQ16849 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTPRNQ16849 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
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PTPRNQ16849 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
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PTPRNQ16849 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
PTPRNQ16849 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTPRNQ16849 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
PTPRNQ16849 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTPRNQ16849 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTPRNQ16849 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTPRNQ16849 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTPRNQ16849 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTPRNQ16849 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTPRNQ16849 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTPRNQ16849 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTPRNQ16849 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
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