Protein–RNA interactions for Protein: Q16795

NDUFA9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 9, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA9Q16795 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NDUFA9Q16795 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NDUFA9Q16795 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NDUFA9Q16795 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
NDUFA9Q16795 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NDUFA9Q16795 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NDUFA9Q16795 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NDUFA9Q16795 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NDUFA9Q16795 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NDUFA9Q16795 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NDUFA9Q16795 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NDUFA9Q16795 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NDUFA9Q16795 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NDUFA9Q16795 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NDUFA9Q16795 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NDUFA9Q16795 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NDUFA9Q16795 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NDUFA9Q16795 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NDUFA9Q16795 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NDUFA9Q16795 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NDUFA9Q16795 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NDUFA9Q16795 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NDUFA9Q16795 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NDUFA9Q16795 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NDUFA9Q16795 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NDUFA9Q16795 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NDUFA9Q16795 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NDUFA9Q16795 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NDUFA9Q16795 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NDUFA9Q16795 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NDUFA9Q16795 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NDUFA9Q16795 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
NDUFA9Q16795 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NDUFA9Q16795 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NDUFA9Q16795 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NDUFA9Q16795 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NDUFA9Q16795 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NDUFA9Q16795 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NDUFA9Q16795 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NDUFA9Q16795 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NDUFA9Q16795 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NDUFA9Q16795 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NDUFA9Q16795 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NDUFA9Q16795 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NDUFA9Q16795 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NDUFA9Q16795 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NDUFA9Q16795 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NDUFA9Q16795 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NDUFA9Q16795 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NDUFA9Q16795 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NDUFA9Q16795 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NDUFA9Q16795 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
NDUFA9Q16795 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NDUFA9Q16795 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NDUFA9Q16795 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
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NDUFA9Q16795 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NDUFA9Q16795 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NDUFA9Q16795 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NDUFA9Q16795 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NDUFA9Q16795 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NDUFA9Q16795 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NDUFA9Q16795 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
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NDUFA9Q16795 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NDUFA9Q16795 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NDUFA9Q16795 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NDUFA9Q16795 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NDUFA9Q16795 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
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NDUFA9Q16795 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NDUFA9Q16795 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
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NDUFA9Q16795 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NDUFA9Q16795 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
NDUFA9Q16795 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NDUFA9Q16795 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NDUFA9Q16795 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NDUFA9Q16795 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NDUFA9Q16795 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NDUFA9Q16795 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NDUFA9Q16795 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NDUFA9Q16795 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NDUFA9Q16795 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NDUFA9Q16795 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NDUFA9Q16795 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NDUFA9Q16795 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NDUFA9Q16795 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NDUFA9Q16795 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NDUFA9Q16795 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NDUFA9Q16795 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NDUFA9Q16795 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NDUFA9Q16795 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NDUFA9Q16795 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NDUFA9Q16795 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NDUFA9Q16795 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NDUFA9Q16795 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NDUFA9Q16795 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NDUFA9Q16795 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
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