Protein–RNA interactions for Protein: Q16666

IFI16, Gamma-interferon-inducible protein 16, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFI16Q16666 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
IFI16Q16666 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
IFI16Q16666 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
IFI16Q16666 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
IFI16Q16666 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
IFI16Q16666 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
IFI16Q16666 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
IFI16Q16666 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
IFI16Q16666 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
IFI16Q16666 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
IFI16Q16666 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
IFI16Q16666 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
IFI16Q16666 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
IFI16Q16666 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
IFI16Q16666 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
IFI16Q16666 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC20.75■□□□□ 0.91
IFI16Q16666 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
IFI16Q16666 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
IFI16Q16666 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
IFI16Q16666 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
IFI16Q16666 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
IFI16Q16666 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
IFI16Q16666 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
IFI16Q16666 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
IFI16Q16666 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
IFI16Q16666 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
IFI16Q16666 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
IFI16Q16666 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
IFI16Q16666 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
IFI16Q16666 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
IFI16Q16666 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
IFI16Q16666 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
IFI16Q16666 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
IFI16Q16666 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
IFI16Q16666 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
IFI16Q16666 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
IFI16Q16666 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
IFI16Q16666 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
IFI16Q16666 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
IFI16Q16666 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
IFI16Q16666 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
IFI16Q16666 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
IFI16Q16666 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
IFI16Q16666 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
IFI16Q16666 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
IFI16Q16666 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
IFI16Q16666 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
IFI16Q16666 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
IFI16Q16666 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
IFI16Q16666 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
IFI16Q16666 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
IFI16Q16666 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
IFI16Q16666 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
IFI16Q16666 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
IFI16Q16666 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
IFI16Q16666 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
IFI16Q16666 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
IFI16Q16666 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
IFI16Q16666 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
IFI16Q16666 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
IFI16Q16666 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
IFI16Q16666 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
IFI16Q16666 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
IFI16Q16666 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
IFI16Q16666 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
IFI16Q16666 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
IFI16Q16666 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
IFI16Q16666 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
IFI16Q16666 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
IFI16Q16666 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
IFI16Q16666 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
IFI16Q16666 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
IFI16Q16666 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
IFI16Q16666 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
IFI16Q16666 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
IFI16Q16666 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
IFI16Q16666 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
IFI16Q16666 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
IFI16Q16666 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
IFI16Q16666 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
IFI16Q16666 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
IFI16Q16666 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
IFI16Q16666 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
IFI16Q16666 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
IFI16Q16666 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
IFI16Q16666 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
IFI16Q16666 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
IFI16Q16666 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
IFI16Q16666 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
IFI16Q16666 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
IFI16Q16666 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
IFI16Q16666 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
IFI16Q16666 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
IFI16Q16666 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
IFI16Q16666 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
IFI16Q16666 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
IFI16Q16666 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
IFI16Q16666 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
IFI16Q16666 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
IFI16Q16666 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms