Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

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Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SGCBQ16585 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SGCBQ16585 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SGCBQ16585 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SGCBQ16585 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SGCBQ16585 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SGCBQ16585 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SGCBQ16585 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SGCBQ16585 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SGCBQ16585 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SGCBQ16585 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SGCBQ16585 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SGCBQ16585 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SGCBQ16585 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SGCBQ16585 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SGCBQ16585 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SGCBQ16585 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SGCBQ16585 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SGCBQ16585 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SGCBQ16585 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SGCBQ16585 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SGCBQ16585 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SGCBQ16585 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SGCBQ16585 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SGCBQ16585 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SGCBQ16585 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SGCBQ16585 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SGCBQ16585 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SGCBQ16585 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SGCBQ16585 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SGCBQ16585 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SGCBQ16585 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SGCBQ16585 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SGCBQ16585 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SGCBQ16585 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SGCBQ16585 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SGCBQ16585 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SGCBQ16585 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SGCBQ16585 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SGCBQ16585 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SGCBQ16585 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SGCBQ16585 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SGCBQ16585 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SGCBQ16585 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SGCBQ16585 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SGCBQ16585 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SGCBQ16585 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SGCBQ16585 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SGCBQ16585 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SGCBQ16585 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SGCBQ16585 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SGCBQ16585 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SGCBQ16585 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SGCBQ16585 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SGCBQ16585 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SGCBQ16585 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SGCBQ16585 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SGCBQ16585 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SGCBQ16585 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SGCBQ16585 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SGCBQ16585 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SGCBQ16585 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SGCBQ16585 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SGCBQ16585 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SGCBQ16585 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SGCBQ16585 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SGCBQ16585 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SGCBQ16585 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SGCBQ16585 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SGCBQ16585 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SGCBQ16585 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SGCBQ16585 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SGCBQ16585 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SGCBQ16585 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SGCBQ16585 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SGCBQ16585 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SGCBQ16585 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SGCBQ16585 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SGCBQ16585 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SGCBQ16585 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SGCBQ16585 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SGCBQ16585 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
SGCBQ16585 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SGCBQ16585 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SGCBQ16585 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SGCBQ16585 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SGCBQ16585 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SGCBQ16585 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
SGCBQ16585 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SGCBQ16585 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SGCBQ16585 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SGCBQ16585 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SGCBQ16585 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SGCBQ16585 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SGCBQ16585 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SGCBQ16585 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SGCBQ16585 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SGCBQ16585 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SGCBQ16585 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SGCBQ16585 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
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