Protein–RNA interactions for Protein: Q16473

TNXA, Putative tenascin-XA, humanhuman

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Length 311 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNXAQ16473 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TNXAQ16473 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TNXAQ16473 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TNXAQ16473 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TNXAQ16473 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TNXAQ16473 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TNXAQ16473 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TNXAQ16473 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TNXAQ16473 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TNXAQ16473 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TNXAQ16473 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TNXAQ16473 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
TNXAQ16473 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TNXAQ16473 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TNXAQ16473 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TNXAQ16473 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
TNXAQ16473 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TNXAQ16473 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TNXAQ16473 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TNXAQ16473 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TNXAQ16473 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TNXAQ16473 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TNXAQ16473 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TNXAQ16473 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
TNXAQ16473 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TNXAQ16473 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TNXAQ16473 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TNXAQ16473 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TNXAQ16473 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TNXAQ16473 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TNXAQ16473 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TNXAQ16473 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TNXAQ16473 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TNXAQ16473 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TNXAQ16473 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TNXAQ16473 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TNXAQ16473 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TNXAQ16473 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TNXAQ16473 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TNXAQ16473 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TNXAQ16473 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TNXAQ16473 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TNXAQ16473 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TNXAQ16473 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TNXAQ16473 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TNXAQ16473 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TNXAQ16473 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TNXAQ16473 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TNXAQ16473 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
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TNXAQ16473 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
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TNXAQ16473 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TNXAQ16473 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TNXAQ16473 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TNXAQ16473 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TNXAQ16473 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TNXAQ16473 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TNXAQ16473 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TNXAQ16473 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TNXAQ16473 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TNXAQ16473 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TNXAQ16473 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TNXAQ16473 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TNXAQ16473 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TNXAQ16473 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TNXAQ16473 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
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TNXAQ16473 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
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TNXAQ16473 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
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TNXAQ16473 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
TNXAQ16473 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
TNXAQ16473 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TNXAQ16473 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TNXAQ16473 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TNXAQ16473 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TNXAQ16473 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TNXAQ16473 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TNXAQ16473 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TNXAQ16473 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TNXAQ16473 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TNXAQ16473 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TNXAQ16473 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TNXAQ16473 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TNXAQ16473 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TNXAQ16473 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TNXAQ16473 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TNXAQ16473 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TNXAQ16473 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TNXAQ16473 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TNXAQ16473 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TNXAQ16473 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
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