Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC6Q16204 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC6Q16204 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC6Q16204 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC6Q16204 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC6Q16204 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC6Q16204 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC6Q16204 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC6Q16204 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC6Q16204 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC6Q16204 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC6Q16204 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC6Q16204 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC6Q16204 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC6Q16204 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC6Q16204 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC6Q16204 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC6Q16204 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC6Q16204 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC6Q16204 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC6Q16204 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC6Q16204 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC6Q16204 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC6Q16204 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC6Q16204 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC6Q16204 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC6Q16204 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC6Q16204 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC6Q16204 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC6Q16204 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC6Q16204 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC6Q16204 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC6Q16204 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC6Q16204 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC6Q16204 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC6Q16204 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC6Q16204 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC6Q16204 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC6Q16204 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC6Q16204 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC6Q16204 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC6Q16204 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC6Q16204 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC6Q16204 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC6Q16204 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC6Q16204 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC6Q16204 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC6Q16204 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC6Q16204 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC6Q16204 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC6Q16204 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC6Q16204 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC6Q16204 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC6Q16204 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC6Q16204 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC6Q16204 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC6Q16204 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC6Q16204 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC6Q16204 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC6Q16204 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC6Q16204 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC6Q16204 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC6Q16204 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC6Q16204 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC6Q16204 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC6Q16204 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC6Q16204 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC6Q16204 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC6Q16204 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC6Q16204 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC6Q16204 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC6Q16204 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC6Q16204 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC6Q16204 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC6Q16204 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC6Q16204 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC6Q16204 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC6Q16204 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC6Q16204 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC6Q16204 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC6Q16204 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC6Q16204 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC6Q16204 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC6Q16204 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC6Q16204 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC6Q16204 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC6Q16204 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC6Q16204 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC6Q16204 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC6Q16204 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC6Q16204 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC6Q16204 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC6Q16204 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC6Q16204 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC6Q16204 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC6Q16204 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC6Q16204 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC6Q16204 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC6Q16204 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC6Q16204 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
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