Protein–RNA interactions for Protein: Q15303

ERBB4, Receptor tyrosine-protein kinase erbB-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERBB4Q15303 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ERBB4Q15303 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
ERBB4Q15303 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
ERBB4Q15303 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.56
ERBB4Q15303 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
ERBB4Q15303 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
ERBB4Q15303 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
ERBB4Q15303 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ERBB4Q15303 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ERBB4Q15303 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ERBB4Q15303 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ERBB4Q15303 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ERBB4Q15303 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ERBB4Q15303 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ERBB4Q15303 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ERBB4Q15303 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ERBB4Q15303 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ERBB4Q15303 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ERBB4Q15303 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ERBB4Q15303 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ERBB4Q15303 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ERBB4Q15303 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ERBB4Q15303 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ERBB4Q15303 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ERBB4Q15303 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ERBB4Q15303 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ERBB4Q15303 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ERBB4Q15303 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ERBB4Q15303 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
ERBB4Q15303 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ERBB4Q15303 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ERBB4Q15303 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ERBB4Q15303 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ERBB4Q15303 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ERBB4Q15303 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ERBB4Q15303 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ERBB4Q15303 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ERBB4Q15303 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ERBB4Q15303 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ERBB4Q15303 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ERBB4Q15303 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ERBB4Q15303 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ERBB4Q15303 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ERBB4Q15303 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ERBB4Q15303 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ERBB4Q15303 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ERBB4Q15303 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ERBB4Q15303 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ERBB4Q15303 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ERBB4Q15303 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ERBB4Q15303 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
ERBB4Q15303 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
ERBB4Q15303 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ERBB4Q15303 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ERBB4Q15303 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ERBB4Q15303 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ERBB4Q15303 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ERBB4Q15303 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ERBB4Q15303 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ERBB4Q15303 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ERBB4Q15303 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ERBB4Q15303 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ERBB4Q15303 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ERBB4Q15303 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ERBB4Q15303 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ERBB4Q15303 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ERBB4Q15303 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ERBB4Q15303 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ERBB4Q15303 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ERBB4Q15303 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ERBB4Q15303 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ERBB4Q15303 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ERBB4Q15303 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ERBB4Q15303 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ERBB4Q15303 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ERBB4Q15303 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ERBB4Q15303 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ERBB4Q15303 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ERBB4Q15303 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ERBB4Q15303 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ERBB4Q15303 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
ERBB4Q15303 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ERBB4Q15303 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ERBB4Q15303 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ERBB4Q15303 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ERBB4Q15303 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ERBB4Q15303 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ERBB4Q15303 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ERBB4Q15303 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
ERBB4Q15303 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ERBB4Q15303 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ERBB4Q15303 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ERBB4Q15303 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ERBB4Q15303 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ERBB4Q15303 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ERBB4Q15303 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ERBB4Q15303 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ERBB4Q15303 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ERBB4Q15303 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
ERBB4Q15303 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms