Protein–RNA interactions for Protein: Q15119

PDK2, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 407 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK2Q15119 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDK2Q15119 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDK2Q15119 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDK2Q15119 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDK2Q15119 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDK2Q15119 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDK2Q15119 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDK2Q15119 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDK2Q15119 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDK2Q15119 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDK2Q15119 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDK2Q15119 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDK2Q15119 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
PDK2Q15119 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDK2Q15119 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDK2Q15119 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDK2Q15119 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDK2Q15119 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDK2Q15119 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDK2Q15119 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDK2Q15119 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDK2Q15119 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDK2Q15119 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PDK2Q15119 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDK2Q15119 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDK2Q15119 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDK2Q15119 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PDK2Q15119 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDK2Q15119 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDK2Q15119 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDK2Q15119 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDK2Q15119 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDK2Q15119 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDK2Q15119 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDK2Q15119 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDK2Q15119 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDK2Q15119 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PDK2Q15119 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDK2Q15119 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDK2Q15119 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDK2Q15119 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDK2Q15119 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDK2Q15119 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
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PDK2Q15119 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDK2Q15119 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDK2Q15119 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDK2Q15119 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
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PDK2Q15119 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDK2Q15119 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
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PDK2Q15119 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDK2Q15119 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDK2Q15119 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDK2Q15119 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
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PDK2Q15119 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDK2Q15119 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDK2Q15119 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDK2Q15119 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDK2Q15119 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDK2Q15119 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDK2Q15119 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
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PDK2Q15119 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDK2Q15119 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDK2Q15119 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDK2Q15119 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDK2Q15119 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDK2Q15119 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDK2Q15119 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDK2Q15119 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDK2Q15119 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDK2Q15119 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PDK2Q15119 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDK2Q15119 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDK2Q15119 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDK2Q15119 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDK2Q15119 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDK2Q15119 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDK2Q15119 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDK2Q15119 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDK2Q15119 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDK2Q15119 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDK2Q15119 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDK2Q15119 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDK2Q15119 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDK2Q15119 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDK2Q15119 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDK2Q15119 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
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