Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NCAPHQ15003 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NCAPHQ15003 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NCAPHQ15003 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NCAPHQ15003 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NCAPHQ15003 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NCAPHQ15003 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NCAPHQ15003 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NCAPHQ15003 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NCAPHQ15003 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NCAPHQ15003 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NCAPHQ15003 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NCAPHQ15003 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
NCAPHQ15003 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NCAPHQ15003 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NCAPHQ15003 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NCAPHQ15003 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NCAPHQ15003 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NCAPHQ15003 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NCAPHQ15003 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NCAPHQ15003 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NCAPHQ15003 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NCAPHQ15003 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NCAPHQ15003 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NCAPHQ15003 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NCAPHQ15003 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NCAPHQ15003 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NCAPHQ15003 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NCAPHQ15003 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NCAPHQ15003 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NCAPHQ15003 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NCAPHQ15003 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NCAPHQ15003 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NCAPHQ15003 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NCAPHQ15003 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NCAPHQ15003 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NCAPHQ15003 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NCAPHQ15003 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NCAPHQ15003 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NCAPHQ15003 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NCAPHQ15003 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NCAPHQ15003 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NCAPHQ15003 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
NCAPHQ15003 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NCAPHQ15003 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NCAPHQ15003 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NCAPHQ15003 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
NCAPHQ15003 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
NCAPHQ15003 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NCAPHQ15003 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NCAPHQ15003 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NCAPHQ15003 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NCAPHQ15003 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NCAPHQ15003 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NCAPHQ15003 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NCAPHQ15003 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NCAPHQ15003 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NCAPHQ15003 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NCAPHQ15003 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NCAPHQ15003 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NCAPHQ15003 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NCAPHQ15003 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NCAPHQ15003 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NCAPHQ15003 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NCAPHQ15003 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NCAPHQ15003 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NCAPHQ15003 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NCAPHQ15003 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NCAPHQ15003 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NCAPHQ15003 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NCAPHQ15003 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NCAPHQ15003 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NCAPHQ15003 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NCAPHQ15003 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NCAPHQ15003 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NCAPHQ15003 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NCAPHQ15003 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NCAPHQ15003 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NCAPHQ15003 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NCAPHQ15003 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NCAPHQ15003 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NCAPHQ15003 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NCAPHQ15003 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NCAPHQ15003 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NCAPHQ15003 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NCAPHQ15003 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NCAPHQ15003 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NCAPHQ15003 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NCAPHQ15003 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NCAPHQ15003 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NCAPHQ15003 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NCAPHQ15003 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NCAPHQ15003 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NCAPHQ15003 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NCAPHQ15003 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NCAPHQ15003 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NCAPHQ15003 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NCAPHQ15003 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NCAPHQ15003 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NCAPHQ15003 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
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