Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHD4Q14839 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHD4Q14839 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHD4Q14839 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHD4Q14839 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHD4Q14839 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CHD4Q14839 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHD4Q14839 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHD4Q14839 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHD4Q14839 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHD4Q14839 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHD4Q14839 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CHD4Q14839 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CHD4Q14839 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHD4Q14839 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHD4Q14839 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHD4Q14839 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHD4Q14839 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHD4Q14839 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHD4Q14839 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHD4Q14839 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHD4Q14839 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHD4Q14839 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHD4Q14839 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CHD4Q14839 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CHD4Q14839 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CHD4Q14839 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHD4Q14839 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHD4Q14839 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHD4Q14839 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHD4Q14839 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHD4Q14839 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHD4Q14839 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHD4Q14839 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHD4Q14839 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CHD4Q14839 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHD4Q14839 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHD4Q14839 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHD4Q14839 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHD4Q14839 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHD4Q14839 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHD4Q14839 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHD4Q14839 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CHD4Q14839 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CHD4Q14839 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHD4Q14839 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHD4Q14839 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHD4Q14839 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHD4Q14839 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHD4Q14839 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHD4Q14839 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHD4Q14839 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHD4Q14839 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHD4Q14839 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CHD4Q14839 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CHD4Q14839 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CHD4Q14839 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHD4Q14839 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHD4Q14839 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHD4Q14839 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHD4Q14839 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CHD4Q14839 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHD4Q14839 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHD4Q14839 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CHD4Q14839 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHD4Q14839 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHD4Q14839 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHD4Q14839 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHD4Q14839 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHD4Q14839 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CHD4Q14839 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHD4Q14839 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHD4Q14839 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHD4Q14839 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHD4Q14839 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHD4Q14839 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHD4Q14839 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHD4Q14839 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHD4Q14839 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHD4Q14839 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHD4Q14839 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHD4Q14839 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHD4Q14839 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHD4Q14839 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHD4Q14839 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHD4Q14839 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHD4Q14839 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHD4Q14839 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHD4Q14839 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHD4Q14839 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHD4Q14839 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHD4Q14839 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHD4Q14839 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHD4Q14839 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHD4Q14839 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHD4Q14839 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHD4Q14839 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHD4Q14839 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHD4Q14839 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHD4Q14839 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
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