Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

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Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
COL4A6Q14031 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
COL4A6Q14031 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
COL4A6Q14031 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
COL4A6Q14031 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
COL4A6Q14031 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
COL4A6Q14031 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
COL4A6Q14031 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
COL4A6Q14031 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
COL4A6Q14031 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
COL4A6Q14031 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
COL4A6Q14031 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
COL4A6Q14031 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
COL4A6Q14031 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
COL4A6Q14031 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
COL4A6Q14031 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
COL4A6Q14031 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
COL4A6Q14031 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
COL4A6Q14031 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
COL4A6Q14031 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
COL4A6Q14031 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
COL4A6Q14031 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
COL4A6Q14031 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
COL4A6Q14031 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
COL4A6Q14031 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
COL4A6Q14031 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
COL4A6Q14031 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
COL4A6Q14031 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
COL4A6Q14031 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
COL4A6Q14031 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
COL4A6Q14031 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
COL4A6Q14031 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
COL4A6Q14031 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
COL4A6Q14031 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
COL4A6Q14031 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
COL4A6Q14031 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
COL4A6Q14031 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
COL4A6Q14031 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
COL4A6Q14031 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
COL4A6Q14031 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
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COL4A6Q14031 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
COL4A6Q14031 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
COL4A6Q14031 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
COL4A6Q14031 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
COL4A6Q14031 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
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COL4A6Q14031 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
COL4A6Q14031 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
COL4A6Q14031 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
COL4A6Q14031 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
COL4A6Q14031 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
COL4A6Q14031 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
COL4A6Q14031 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
COL4A6Q14031 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
COL4A6Q14031 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
COL4A6Q14031 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
COL4A6Q14031 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
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COL4A6Q14031 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
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COL4A6Q14031 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
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COL4A6Q14031 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.91
COL4A6Q14031 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
COL4A6Q14031 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
COL4A6Q14031 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
COL4A6Q14031 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
COL4A6Q14031 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
COL4A6Q14031 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
COL4A6Q14031 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
COL4A6Q14031 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
COL4A6Q14031 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
COL4A6Q14031 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
COL4A6Q14031 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
COL4A6Q14031 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
COL4A6Q14031 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
COL4A6Q14031 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
COL4A6Q14031 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
COL4A6Q14031 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
COL4A6Q14031 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
COL4A6Q14031 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
COL4A6Q14031 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
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