Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CNGB1Q14028 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
CNGB1Q14028 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CNGB1Q14028 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CNGB1Q14028 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CNGB1Q14028 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CNGB1Q14028 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CNGB1Q14028 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CNGB1Q14028 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CNGB1Q14028 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CNGB1Q14028 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CNGB1Q14028 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CNGB1Q14028 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CNGB1Q14028 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CNGB1Q14028 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CNGB1Q14028 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CNGB1Q14028 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CNGB1Q14028 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CNGB1Q14028 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CNGB1Q14028 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CNGB1Q14028 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CNGB1Q14028 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CNGB1Q14028 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
CNGB1Q14028 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
CNGB1Q14028 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
CNGB1Q14028 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CNGB1Q14028 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
CNGB1Q14028 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
CNGB1Q14028 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CNGB1Q14028 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CNGB1Q14028 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CNGB1Q14028 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CNGB1Q14028 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CNGB1Q14028 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CNGB1Q14028 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CNGB1Q14028 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CNGB1Q14028 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CNGB1Q14028 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CNGB1Q14028 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
CNGB1Q14028 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CNGB1Q14028 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CNGB1Q14028 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
CNGB1Q14028 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
CNGB1Q14028 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CNGB1Q14028 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CNGB1Q14028 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CNGB1Q14028 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CNGB1Q14028 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CNGB1Q14028 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CNGB1Q14028 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CNGB1Q14028 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CNGB1Q14028 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CNGB1Q14028 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CNGB1Q14028 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CNGB1Q14028 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CNGB1Q14028 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CNGB1Q14028 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CNGB1Q14028 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CNGB1Q14028 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CNGB1Q14028 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CNGB1Q14028 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CNGB1Q14028 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CNGB1Q14028 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CNGB1Q14028 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CNGB1Q14028 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CNGB1Q14028 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
CNGB1Q14028 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CNGB1Q14028 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CNGB1Q14028 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CNGB1Q14028 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CNGB1Q14028 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CNGB1Q14028 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CNGB1Q14028 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CNGB1Q14028 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CNGB1Q14028 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CNGB1Q14028 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CNGB1Q14028 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CNGB1Q14028 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CNGB1Q14028 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CNGB1Q14028 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CNGB1Q14028 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CNGB1Q14028 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
CNGB1Q14028 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CNGB1Q14028 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CNGB1Q14028 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CNGB1Q14028 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CNGB1Q14028 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CNGB1Q14028 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CNGB1Q14028 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CNGB1Q14028 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CNGB1Q14028 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CNGB1Q14028 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
CNGB1Q14028 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CNGB1Q14028 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CNGB1Q14028 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CNGB1Q14028 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CNGB1Q14028 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CNGB1Q14028 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CNGB1Q14028 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CNGB1Q14028 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
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