Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

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Length 1,029 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ATP1A4Q13733 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ATP1A4Q13733 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ATP1A4Q13733 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ATP1A4Q13733 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ATP1A4Q13733 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ATP1A4Q13733 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ATP1A4Q13733 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ATP1A4Q13733 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ATP1A4Q13733 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ATP1A4Q13733 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ATP1A4Q13733 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ATP1A4Q13733 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ATP1A4Q13733 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ATP1A4Q13733 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ATP1A4Q13733 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
ATP1A4Q13733 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ATP1A4Q13733 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ATP1A4Q13733 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ATP1A4Q13733 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
ATP1A4Q13733 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ATP1A4Q13733 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ATP1A4Q13733 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ATP1A4Q13733 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
ATP1A4Q13733 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ATP1A4Q13733 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ATP1A4Q13733 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ATP1A4Q13733 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ATP1A4Q13733 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ATP1A4Q13733 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ATP1A4Q13733 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ATP1A4Q13733 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ATP1A4Q13733 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ATP1A4Q13733 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ATP1A4Q13733 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ATP1A4Q13733 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ATP1A4Q13733 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ATP1A4Q13733 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ATP1A4Q13733 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ATP1A4Q13733 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ATP1A4Q13733 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ATP1A4Q13733 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ATP1A4Q13733 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ATP1A4Q13733 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ATP1A4Q13733 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ATP1A4Q13733 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ATP1A4Q13733 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ATP1A4Q13733 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ATP1A4Q13733 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ATP1A4Q13733 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ATP1A4Q13733 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ATP1A4Q13733 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ATP1A4Q13733 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ATP1A4Q13733 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ATP1A4Q13733 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ATP1A4Q13733 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ATP1A4Q13733 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
ATP1A4Q13733 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ATP1A4Q13733 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ATP1A4Q13733 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ATP1A4Q13733 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ATP1A4Q13733 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ATP1A4Q13733 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ATP1A4Q13733 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ATP1A4Q13733 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ATP1A4Q13733 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ATP1A4Q13733 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ATP1A4Q13733 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ATP1A4Q13733 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ATP1A4Q13733 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
ATP1A4Q13733 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ATP1A4Q13733 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
ATP1A4Q13733 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ATP1A4Q13733 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ATP1A4Q13733 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ATP1A4Q13733 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
ATP1A4Q13733 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ATP1A4Q13733 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ATP1A4Q13733 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ATP1A4Q13733 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ATP1A4Q13733 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ATP1A4Q13733 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ATP1A4Q13733 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
ATP1A4Q13733 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ATP1A4Q13733 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ATP1A4Q13733 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ATP1A4Q13733 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ATP1A4Q13733 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ATP1A4Q13733 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ATP1A4Q13733 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ATP1A4Q13733 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ATP1A4Q13733 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ATP1A4Q13733 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ATP1A4Q13733 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ATP1A4Q13733 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
ATP1A4Q13733 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ATP1A4Q13733 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ATP1A4Q13733 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ATP1A4Q13733 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ATP1A4Q13733 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
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