Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

Predictions only

Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CACNA1SQ13698 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CACNA1SQ13698 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CACNA1SQ13698 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CACNA1SQ13698 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CACNA1SQ13698 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CACNA1SQ13698 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CACNA1SQ13698 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CACNA1SQ13698 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CACNA1SQ13698 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CACNA1SQ13698 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CACNA1SQ13698 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CACNA1SQ13698 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.43
CACNA1SQ13698 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CACNA1SQ13698 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CACNA1SQ13698 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CACNA1SQ13698 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CACNA1SQ13698 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CACNA1SQ13698 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CACNA1SQ13698 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CACNA1SQ13698 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CACNA1SQ13698 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CACNA1SQ13698 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CACNA1SQ13698 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CACNA1SQ13698 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CACNA1SQ13698 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CACNA1SQ13698 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CACNA1SQ13698 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
CACNA1SQ13698 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
CACNA1SQ13698 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CACNA1SQ13698 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CACNA1SQ13698 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CACNA1SQ13698 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CACNA1SQ13698 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CACNA1SQ13698 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
CACNA1SQ13698 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CACNA1SQ13698 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
CACNA1SQ13698 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CACNA1SQ13698 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CACNA1SQ13698 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CACNA1SQ13698 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CACNA1SQ13698 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CACNA1SQ13698 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CACNA1SQ13698 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
CACNA1SQ13698 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CACNA1SQ13698 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CACNA1SQ13698 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CACNA1SQ13698 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CACNA1SQ13698 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CACNA1SQ13698 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CACNA1SQ13698 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CACNA1SQ13698 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CACNA1SQ13698 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CACNA1SQ13698 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CACNA1SQ13698 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CACNA1SQ13698 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CACNA1SQ13698 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CACNA1SQ13698 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CACNA1SQ13698 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CACNA1SQ13698 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CACNA1SQ13698 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CACNA1SQ13698 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CACNA1SQ13698 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CACNA1SQ13698 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CACNA1SQ13698 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CACNA1SQ13698 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CACNA1SQ13698 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CACNA1SQ13698 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CACNA1SQ13698 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CACNA1SQ13698 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CACNA1SQ13698 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CACNA1SQ13698 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CACNA1SQ13698 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CACNA1SQ13698 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CACNA1SQ13698 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CACNA1SQ13698 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CACNA1SQ13698 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CACNA1SQ13698 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CACNA1SQ13698 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CACNA1SQ13698 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CACNA1SQ13698 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CACNA1SQ13698 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CACNA1SQ13698 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CACNA1SQ13698 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CACNA1SQ13698 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CACNA1SQ13698 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CACNA1SQ13698 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CACNA1SQ13698 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CACNA1SQ13698 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CACNA1SQ13698 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CACNA1SQ13698 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CACNA1SQ13698 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CACNA1SQ13698 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CACNA1SQ13698 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CACNA1SQ13698 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CACNA1SQ13698 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CACNA1SQ13698 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CACNA1SQ13698 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CACNA1SQ13698 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CACNA1SQ13698 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
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