Protein–RNA interactions for Protein: Q13643

FHL3, Four and a half LIM domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHL3Q13643 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
FHL3Q13643 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
FHL3Q13643 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
FHL3Q13643 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
FHL3Q13643 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
FHL3Q13643 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
FHL3Q13643 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
FHL3Q13643 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
FHL3Q13643 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
FHL3Q13643 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
FHL3Q13643 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
FHL3Q13643 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
FHL3Q13643 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
FHL3Q13643 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
FHL3Q13643 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
FHL3Q13643 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
FHL3Q13643 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
FHL3Q13643 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
FHL3Q13643 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
FHL3Q13643 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
FHL3Q13643 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
FHL3Q13643 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
FHL3Q13643 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
FHL3Q13643 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
FHL3Q13643 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
FHL3Q13643 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
FHL3Q13643 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
FHL3Q13643 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
FHL3Q13643 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
FHL3Q13643 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
FHL3Q13643 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
FHL3Q13643 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
FHL3Q13643 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
FHL3Q13643 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
FHL3Q13643 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
FHL3Q13643 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
FHL3Q13643 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
FHL3Q13643 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
FHL3Q13643 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
FHL3Q13643 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
FHL3Q13643 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
FHL3Q13643 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
FHL3Q13643 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
FHL3Q13643 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
FHL3Q13643 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
FHL3Q13643 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
FHL3Q13643 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
FHL3Q13643 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
FHL3Q13643 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
FHL3Q13643 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
FHL3Q13643 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
FHL3Q13643 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
FHL3Q13643 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
FHL3Q13643 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC14.88□□□□□ -0.03
FHL3Q13643 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
FHL3Q13643 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
FHL3Q13643 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
FHL3Q13643 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
FHL3Q13643 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
FHL3Q13643 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
FHL3Q13643 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
FHL3Q13643 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
FHL3Q13643 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
FHL3Q13643 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
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FHL3Q13643 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
FHL3Q13643 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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FHL3Q13643 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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FHL3Q13643 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
FHL3Q13643 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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FHL3Q13643 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
FHL3Q13643 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
FHL3Q13643 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
FHL3Q13643 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
FHL3Q13643 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
FHL3Q13643 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
FHL3Q13643 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
FHL3Q13643 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
FHL3Q13643 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
FHL3Q13643 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
FHL3Q13643 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
FHL3Q13643 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
FHL3Q13643 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
FHL3Q13643 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
FHL3Q13643 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
FHL3Q13643 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
FHL3Q13643 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
FHL3Q13643 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
FHL3Q13643 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
FHL3Q13643 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
FHL3Q13643 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
FHL3Q13643 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
FHL3Q13643 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
FHL3Q13643 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
FHL3Q13643 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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