Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
NEUROD1Q13562 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
NEUROD1Q13562 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
NEUROD1Q13562 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
NEUROD1Q13562 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
NEUROD1Q13562 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
NEUROD1Q13562 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
NEUROD1Q13562 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
NEUROD1Q13562 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
NEUROD1Q13562 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
NEUROD1Q13562 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
NEUROD1Q13562 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
NEUROD1Q13562 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
NEUROD1Q13562 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
NEUROD1Q13562 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
NEUROD1Q13562 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
NEUROD1Q13562 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
NEUROD1Q13562 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
NEUROD1Q13562 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
NEUROD1Q13562 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
NEUROD1Q13562 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
NEUROD1Q13562 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
NEUROD1Q13562 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
NEUROD1Q13562 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
NEUROD1Q13562 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
NEUROD1Q13562 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
NEUROD1Q13562 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
NEUROD1Q13562 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
NEUROD1Q13562 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
NEUROD1Q13562 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
NEUROD1Q13562 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
NEUROD1Q13562 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
NEUROD1Q13562 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
NEUROD1Q13562 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
NEUROD1Q13562 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
NEUROD1Q13562 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
NEUROD1Q13562 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
NEUROD1Q13562 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
NEUROD1Q13562 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
NEUROD1Q13562 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
NEUROD1Q13562 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
NEUROD1Q13562 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
NEUROD1Q13562 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
NEUROD1Q13562 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
NEUROD1Q13562 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
NEUROD1Q13562 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
NEUROD1Q13562 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
NEUROD1Q13562 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
NEUROD1Q13562 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
NEUROD1Q13562 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
NEUROD1Q13562 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
NEUROD1Q13562 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
NEUROD1Q13562 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
NEUROD1Q13562 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
NEUROD1Q13562 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
NEUROD1Q13562 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
NEUROD1Q13562 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
NEUROD1Q13562 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
NEUROD1Q13562 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
NEUROD1Q13562 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
NEUROD1Q13562 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
NEUROD1Q13562 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
NEUROD1Q13562 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
NEUROD1Q13562 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
NEUROD1Q13562 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
NEUROD1Q13562 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
NEUROD1Q13562 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
NEUROD1Q13562 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
NEUROD1Q13562 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
NEUROD1Q13562 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
NEUROD1Q13562 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
NEUROD1Q13562 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
NEUROD1Q13562 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
NEUROD1Q13562 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
NEUROD1Q13562 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
NEUROD1Q13562 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
NEUROD1Q13562 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC28.63■■■□□ 2.17
NEUROD1Q13562 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
NEUROD1Q13562 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
NEUROD1Q13562 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
NEUROD1Q13562 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
NEUROD1Q13562 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
NEUROD1Q13562 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
NEUROD1Q13562 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
NEUROD1Q13562 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
NEUROD1Q13562 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
NEUROD1Q13562 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
NEUROD1Q13562 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
NEUROD1Q13562 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
NEUROD1Q13562 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
NEUROD1Q13562 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
NEUROD1Q13562 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
NEUROD1Q13562 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
NEUROD1Q13562 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
NEUROD1Q13562 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
NEUROD1Q13562 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
NEUROD1Q13562 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
NEUROD1Q13562 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
NEUROD1Q13562 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
NEUROD1Q13562 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
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