Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HDAC1Q13547 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HDAC1Q13547 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HDAC1Q13547 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HDAC1Q13547 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HDAC1Q13547 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HDAC1Q13547 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HDAC1Q13547 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HDAC1Q13547 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
HDAC1Q13547 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HDAC1Q13547 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HDAC1Q13547 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HDAC1Q13547 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HDAC1Q13547 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HDAC1Q13547 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HDAC1Q13547 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HDAC1Q13547 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HDAC1Q13547 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HDAC1Q13547 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HDAC1Q13547 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HDAC1Q13547 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HDAC1Q13547 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HDAC1Q13547 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HDAC1Q13547 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HDAC1Q13547 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HDAC1Q13547 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HDAC1Q13547 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HDAC1Q13547 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
HDAC1Q13547 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
HDAC1Q13547 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HDAC1Q13547 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HDAC1Q13547 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HDAC1Q13547 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HDAC1Q13547 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HDAC1Q13547 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HDAC1Q13547 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HDAC1Q13547 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HDAC1Q13547 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HDAC1Q13547 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HDAC1Q13547 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HDAC1Q13547 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HDAC1Q13547 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HDAC1Q13547 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
HDAC1Q13547 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
HDAC1Q13547 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
HDAC1Q13547 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HDAC1Q13547 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HDAC1Q13547 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HDAC1Q13547 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
HDAC1Q13547 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HDAC1Q13547 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HDAC1Q13547 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HDAC1Q13547 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HDAC1Q13547 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HDAC1Q13547 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HDAC1Q13547 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HDAC1Q13547 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HDAC1Q13547 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HDAC1Q13547 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HDAC1Q13547 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HDAC1Q13547 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HDAC1Q13547 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HDAC1Q13547 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HDAC1Q13547 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
HDAC1Q13547 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HDAC1Q13547 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HDAC1Q13547 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HDAC1Q13547 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HDAC1Q13547 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HDAC1Q13547 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HDAC1Q13547 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HDAC1Q13547 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HDAC1Q13547 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HDAC1Q13547 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HDAC1Q13547 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HDAC1Q13547 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HDAC1Q13547 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HDAC1Q13547 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HDAC1Q13547 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HDAC1Q13547 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HDAC1Q13547 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HDAC1Q13547 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HDAC1Q13547 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HDAC1Q13547 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HDAC1Q13547 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HDAC1Q13547 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HDAC1Q13547 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HDAC1Q13547 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HDAC1Q13547 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HDAC1Q13547 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HDAC1Q13547 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HDAC1Q13547 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HDAC1Q13547 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HDAC1Q13547 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HDAC1Q13547 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HDAC1Q13547 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HDAC1Q13547 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HDAC1Q13547 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HDAC1Q13547 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HDAC1Q13547 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
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