Protein–RNA interactions for Protein: Q13523

PRPF4B, Serine/threonine-protein kinase PRP4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4BQ13523 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRPF4BQ13523 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRPF4BQ13523 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRPF4BQ13523 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRPF4BQ13523 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PRPF4BQ13523 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRPF4BQ13523 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRPF4BQ13523 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRPF4BQ13523 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRPF4BQ13523 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRPF4BQ13523 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRPF4BQ13523 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRPF4BQ13523 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PRPF4BQ13523 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PRPF4BQ13523 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRPF4BQ13523 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRPF4BQ13523 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRPF4BQ13523 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRPF4BQ13523 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRPF4BQ13523 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRPF4BQ13523 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PRPF4BQ13523 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRPF4BQ13523 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRPF4BQ13523 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRPF4BQ13523 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRPF4BQ13523 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRPF4BQ13523 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRPF4BQ13523 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRPF4BQ13523 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRPF4BQ13523 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRPF4BQ13523 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRPF4BQ13523 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRPF4BQ13523 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PRPF4BQ13523 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PRPF4BQ13523 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRPF4BQ13523 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRPF4BQ13523 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRPF4BQ13523 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRPF4BQ13523 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRPF4BQ13523 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRPF4BQ13523 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRPF4BQ13523 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRPF4BQ13523 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PRPF4BQ13523 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRPF4BQ13523 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRPF4BQ13523 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRPF4BQ13523 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRPF4BQ13523 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRPF4BQ13523 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRPF4BQ13523 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRPF4BQ13523 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRPF4BQ13523 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRPF4BQ13523 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRPF4BQ13523 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRPF4BQ13523 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRPF4BQ13523 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRPF4BQ13523 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRPF4BQ13523 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRPF4BQ13523 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PRPF4BQ13523 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRPF4BQ13523 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRPF4BQ13523 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRPF4BQ13523 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRPF4BQ13523 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRPF4BQ13523 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRPF4BQ13523 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRPF4BQ13523 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRPF4BQ13523 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRPF4BQ13523 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRPF4BQ13523 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRPF4BQ13523 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRPF4BQ13523 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PRPF4BQ13523 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRPF4BQ13523 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRPF4BQ13523 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRPF4BQ13523 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRPF4BQ13523 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRPF4BQ13523 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRPF4BQ13523 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRPF4BQ13523 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRPF4BQ13523 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRPF4BQ13523 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRPF4BQ13523 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRPF4BQ13523 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRPF4BQ13523 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRPF4BQ13523 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRPF4BQ13523 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRPF4BQ13523 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRPF4BQ13523 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRPF4BQ13523 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PRPF4BQ13523 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRPF4BQ13523 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRPF4BQ13523 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRPF4BQ13523 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRPF4BQ13523 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRPF4BQ13523 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRPF4BQ13523 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRPF4BQ13523 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRPF4BQ13523 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PRPF4BQ13523 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
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