Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

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Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SGCGQ13326 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SGCGQ13326 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
SGCGQ13326 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SGCGQ13326 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SGCGQ13326 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SGCGQ13326 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SGCGQ13326 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
SGCGQ13326 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SGCGQ13326 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SGCGQ13326 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SGCGQ13326 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SGCGQ13326 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
SGCGQ13326 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SGCGQ13326 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
SGCGQ13326 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SGCGQ13326 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SGCGQ13326 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SGCGQ13326 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SGCGQ13326 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SGCGQ13326 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SGCGQ13326 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SGCGQ13326 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SGCGQ13326 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SGCGQ13326 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SGCGQ13326 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SGCGQ13326 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SGCGQ13326 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SGCGQ13326 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SGCGQ13326 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SGCGQ13326 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
SGCGQ13326 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SGCGQ13326 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SGCGQ13326 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SGCGQ13326 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SGCGQ13326 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SGCGQ13326 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
SGCGQ13326 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
SGCGQ13326 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SGCGQ13326 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SGCGQ13326 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SGCGQ13326 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SGCGQ13326 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SGCGQ13326 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SGCGQ13326 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SGCGQ13326 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SGCGQ13326 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SGCGQ13326 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SGCGQ13326 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SGCGQ13326 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SGCGQ13326 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SGCGQ13326 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SGCGQ13326 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SGCGQ13326 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SGCGQ13326 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SGCGQ13326 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SGCGQ13326 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SGCGQ13326 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SGCGQ13326 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SGCGQ13326 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SGCGQ13326 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SGCGQ13326 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SGCGQ13326 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SGCGQ13326 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SGCGQ13326 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SGCGQ13326 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SGCGQ13326 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SGCGQ13326 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
SGCGQ13326 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
SGCGQ13326 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SGCGQ13326 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SGCGQ13326 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SGCGQ13326 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SGCGQ13326 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SGCGQ13326 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SGCGQ13326 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SGCGQ13326 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SGCGQ13326 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SGCGQ13326 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SGCGQ13326 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SGCGQ13326 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SGCGQ13326 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SGCGQ13326 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SGCGQ13326 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
SGCGQ13326 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SGCGQ13326 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SGCGQ13326 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SGCGQ13326 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SGCGQ13326 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SGCGQ13326 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SGCGQ13326 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SGCGQ13326 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SGCGQ13326 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SGCGQ13326 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SGCGQ13326 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SGCGQ13326 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SGCGQ13326 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SGCGQ13326 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SGCGQ13326 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SGCGQ13326 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
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