Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CHAF1BQ13112 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHAF1BQ13112 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHAF1BQ13112 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHAF1BQ13112 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CHAF1BQ13112 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHAF1BQ13112 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHAF1BQ13112 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHAF1BQ13112 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHAF1BQ13112 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHAF1BQ13112 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHAF1BQ13112 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHAF1BQ13112 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHAF1BQ13112 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHAF1BQ13112 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHAF1BQ13112 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHAF1BQ13112 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHAF1BQ13112 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHAF1BQ13112 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CHAF1BQ13112 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHAF1BQ13112 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHAF1BQ13112 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CHAF1BQ13112 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CHAF1BQ13112 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHAF1BQ13112 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHAF1BQ13112 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHAF1BQ13112 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHAF1BQ13112 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHAF1BQ13112 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHAF1BQ13112 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHAF1BQ13112 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHAF1BQ13112 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHAF1BQ13112 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHAF1BQ13112 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHAF1BQ13112 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHAF1BQ13112 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHAF1BQ13112 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHAF1BQ13112 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHAF1BQ13112 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHAF1BQ13112 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHAF1BQ13112 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CHAF1BQ13112 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CHAF1BQ13112 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CHAF1BQ13112 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHAF1BQ13112 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CHAF1BQ13112 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHAF1BQ13112 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHAF1BQ13112 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHAF1BQ13112 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHAF1BQ13112 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHAF1BQ13112 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHAF1BQ13112 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHAF1BQ13112 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHAF1BQ13112 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHAF1BQ13112 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
CHAF1BQ13112 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
CHAF1BQ13112 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHAF1BQ13112 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHAF1BQ13112 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHAF1BQ13112 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHAF1BQ13112 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHAF1BQ13112 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHAF1BQ13112 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CHAF1BQ13112 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHAF1BQ13112 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHAF1BQ13112 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHAF1BQ13112 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CHAF1BQ13112 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHAF1BQ13112 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHAF1BQ13112 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CHAF1BQ13112 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CHAF1BQ13112 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CHAF1BQ13112 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CHAF1BQ13112 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHAF1BQ13112 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHAF1BQ13112 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHAF1BQ13112 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHAF1BQ13112 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHAF1BQ13112 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHAF1BQ13112 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHAF1BQ13112 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHAF1BQ13112 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHAF1BQ13112 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHAF1BQ13112 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHAF1BQ13112 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHAF1BQ13112 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHAF1BQ13112 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHAF1BQ13112 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHAF1BQ13112 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHAF1BQ13112 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHAF1BQ13112 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CHAF1BQ13112 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHAF1BQ13112 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHAF1BQ13112 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHAF1BQ13112 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHAF1BQ13112 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHAF1BQ13112 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHAF1BQ13112 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHAF1BQ13112 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CHAF1BQ13112 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
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