Protein–RNA interactions for Protein: Q12988

HSPB3, Heat shock protein beta-3, humanhuman

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Length 150 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPB3Q12988 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
HSPB3Q12988 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
HSPB3Q12988 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HSPB3Q12988 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HSPB3Q12988 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HSPB3Q12988 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HSPB3Q12988 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HSPB3Q12988 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HSPB3Q12988 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
HSPB3Q12988 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HSPB3Q12988 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HSPB3Q12988 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HSPB3Q12988 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HSPB3Q12988 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HSPB3Q12988 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HSPB3Q12988 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HSPB3Q12988 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
HSPB3Q12988 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HSPB3Q12988 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HSPB3Q12988 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HSPB3Q12988 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HSPB3Q12988 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HSPB3Q12988 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HSPB3Q12988 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HSPB3Q12988 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HSPB3Q12988 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HSPB3Q12988 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HSPB3Q12988 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HSPB3Q12988 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HSPB3Q12988 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HSPB3Q12988 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HSPB3Q12988 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HSPB3Q12988 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HSPB3Q12988 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HSPB3Q12988 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HSPB3Q12988 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HSPB3Q12988 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HSPB3Q12988 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HSPB3Q12988 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HSPB3Q12988 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HSPB3Q12988 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HSPB3Q12988 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HSPB3Q12988 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HSPB3Q12988 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HSPB3Q12988 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HSPB3Q12988 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HSPB3Q12988 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HSPB3Q12988 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HSPB3Q12988 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HSPB3Q12988 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HSPB3Q12988 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HSPB3Q12988 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HSPB3Q12988 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HSPB3Q12988 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HSPB3Q12988 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HSPB3Q12988 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HSPB3Q12988 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HSPB3Q12988 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HSPB3Q12988 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HSPB3Q12988 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HSPB3Q12988 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HSPB3Q12988 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HSPB3Q12988 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HSPB3Q12988 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HSPB3Q12988 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HSPB3Q12988 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HSPB3Q12988 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HSPB3Q12988 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HSPB3Q12988 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HSPB3Q12988 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HSPB3Q12988 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HSPB3Q12988 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
HSPB3Q12988 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HSPB3Q12988 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HSPB3Q12988 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HSPB3Q12988 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HSPB3Q12988 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HSPB3Q12988 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HSPB3Q12988 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HSPB3Q12988 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HSPB3Q12988 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HSPB3Q12988 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HSPB3Q12988 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HSPB3Q12988 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HSPB3Q12988 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HSPB3Q12988 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HSPB3Q12988 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HSPB3Q12988 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HSPB3Q12988 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HSPB3Q12988 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HSPB3Q12988 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HSPB3Q12988 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HSPB3Q12988 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HSPB3Q12988 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HSPB3Q12988 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HSPB3Q12988 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HSPB3Q12988 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HSPB3Q12988 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HSPB3Q12988 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
HSPB3Q12988 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
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